RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 WASHC2DQ5SRD0 308 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 C11orf88Q6PI97 169 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 BBS7Q8IWZ6 715 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 ZBED8Q8IZ13 594 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 HPS3Q969F9 1004 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 PHACTR3Q96KR7 559 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 SELENONQ9NZV5 590 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 IL2RBP14784 551 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 S100A1P23297 94 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 MMGT1Q8N4V1 131 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 USHBP1Q8N6Y0 703 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 S100ZQ8WXG8 99 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 MTERF3Q96E29 417 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 NSL1Q96IY1 281 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 KLHL20Q9Y2M5 609 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 CFAP99D6REC4 459 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 ORC4O43929 436 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 SAT1P21673 171 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 PSMA2P25787 234 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 IMPG1Q17R60 797 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 CYGBQ8WWM9 190 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 OTULINQ96BN8 352 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 AGBL1Q96MI9 1066 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 KRT76Q01546 638 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 RESTQ13127 1097 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 PTK2BQ14289 1009 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 RABGAP1LQ5R372 815 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 ANKS3Q6ZW76 656 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 CDH24Q86UP0 819 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 KCND2Q9NZV8 630 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 ADGRG1Q9Y653 693 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 CHN1P15882 459 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 TALDO1P37837 337 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 PIGOQ8TEQ8 1089 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 FAM153AQ9UHL3 310 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 IFNAR1P17181 557 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 SOX5P35711 763 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 CALML6Q8TD86 181 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 C8orf4Q9NR00 106 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 GTSE1Q9NYZ3 720 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 FBXL5Q9UKA1 691 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 ABCB11O95342 1321 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 CAPN1P07384 714 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 IL12RB1P42701 662 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 RAB15P59190 212 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 NAA35Q5VZE5 725 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 SLC7A3Q8WY07 619 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 RHBDL2Q9NX52 303 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 PTPRTO14522 1441 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 DLATP10515 647 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 NQO1P15559 274 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 TKTP29401 623 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 TNFAIP2Q03169 654 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 PPP2R3CQ969Q6 453 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 IL17RAQ96F46 866 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 MMS19Q96T76 1030 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 STARD13Q9Y3M8 1113 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 KRT14P02533 472 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 MXI1P50539 228 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 FAM45BPQ6NSW5 357 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 FAM58BPP0C7Q3 252 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 CCND2P30279 289 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 SERPINB8P50452 374 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 SLC7A5Q01650 507 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 CTDSPL2Q05D32 466 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 SNX17Q15036 470 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 XKR9Q5GH70 373 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 RIC8BQ9NVN3 520 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 LRRC53A6NM62 1247 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 BIRC5O15392 142 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 VCAM1P19320 739 aa5.82□□□□□ -1.48
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