RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289382.7

CNOT11-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT11, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11-201ENST00000289382 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.18■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.18■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 PHF2O75151 1096 aa20.18■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 MYBL1P10243 752 aa20.18■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 GNAT1P11488 350 aa20.18■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 SFR1Q86XK3 245 aa20.18■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 PARP2Q9UGN5 583 aa20.18■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 LRRC42Q9Y546 428 aa20.18■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.18■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 PFASO15067 1338 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 SMIM24O75264 130 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 RARGP13631 454 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 VCAM1P19320 739 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 TUBP50607 506 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 SLC12A3P55017 1021 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 CLIC2O15247 247 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 POLD1P28340 1107 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 RPS6KA3P51812 740 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 CGB2Q6NT52 195 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 CCDC25Q86WR0 208 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 CKAP2Q8WWK9 683 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 SLC35C1Q96A29 364 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 ARHGEF26Q96DR7 871 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 KLHL14Q9P2G3 628 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 LRRD1A4D1F6 860 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 GH1P01241 217 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 PDHA1P08559 390 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 TMEM253P0C7T8 217 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 PCK1P35558 622 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 MXRA7P84157 204 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.822e-10■■□□□ 14
CNOT11-201ENST00000289382 USH1GQ495M9 461 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 MAP3K13O43283 966 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 CHRNA3P32297 505 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 RAD23BP54727 409 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 GIT2Q14161 759 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 PRR16Q569H4 304 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 TTC27Q6P3X3 843 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 MFN1Q8IWA4 741 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 PRELID2Q8N945 189 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 KCNK9Q9NPC2 374 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 LY75O60449 1722 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 UTRNP46939 3433 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 RSPH10BP0C881 870 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 CALB2P22676 271 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 KCNA1Q09470 495 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 PODXLO00592 558 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 PEX11AO75192 247 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 CYP4A11Q02928 519 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 TRAF1Q13077 416 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 RNF43Q68DV7 783 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 RUNDC3BQ96NL0 473 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 REEP2Q9BRK0 252 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 TAS2R14Q9NYV8 317 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 FOCADQ5VW36 1801 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.14■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 MEIS2O14770 477 aa20.14■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 IRF6O14896 467 aa20.14■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 NR3C1P04150 777 aa20.14■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 ANO3Q9BYT9 981 aa20.14■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.14■□□□□ 0.82
CNOT11-201ENST00000289382 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.8 ms