RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 AGPAT1Q99943 283 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CFAP69A5D8W1 941 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 POTEJP0CG39 1038 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 GHRP10912 638 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ITIH4Q14624 930 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 BATF3Q9NR55 127 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 MTMR4Q9NYA4 1195 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 MYH7P12883 1935 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 PDXKO00764 312 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 TXNDC9O14530 226 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 RIPK2O43353 540 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 FBXO11Q86XK2 927 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 PARD3BQ8TEW8 1205 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 HAS1Q92839 578 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 SPEF2Q9C093 1822 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 AP1G2O75843 785 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 PIAS1O75925 651 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 TMEM253P0C7T8 217 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 SLC35C1Q96A29 364 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 NGLY1Q96IV0 654 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 GBP5Q96PP8 586 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 H0YGN5 161 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ASAP2O43150 1006 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 OVGP1Q12889 678 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 PASD1Q8IV76 773 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CYP2W1Q8TAV3 490 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 DYDC2Q96IM9 177 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 STK33Q9BYT3 514 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 GGA2Q9UJY4 613 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 NFS1Q9Y697 457 aa16.37■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 MAPK13O15264 365 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 PYGMP11217 842 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 NCALDP61601 193 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 DYNLT1P63172 113 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 GIT2Q14161 759 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CCDC62Q6P9F0 684 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 TMEM154Q6P9G4 183 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 MGRN1O60291 552 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 MXI1P50539 228 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ITGA8P53708 1063 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 C6orf163Q5TEZ5 329 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CPXCR1Q8N123 301 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 NPHS2Q9NP85 383 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 APEX2Q9UBZ4 518 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 PPIP5K2O43314 1243 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 PPFIA2O75334 1257 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 HSPA6P17066 643 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 AUHQ13825 339 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CNGA2Q16280 664 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 EXOC3L1Q86VI1 746 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 LRRC57Q8N9N7 239 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 COILP38432 576 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CLUL1Q15846 466 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 HIPK4Q8NE63 616 aa16.36■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 MYO3BQ8WXR4 1341 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CBX6O95503 412 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 PLS3P13797 630 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 PRUNE1Q86TP1 453 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 C8orf37Q96NL8 207 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CALCAP01258 141 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ECHS1P30084 290 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 SLC30A9Q6PML9 568 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 KIFAP3Q92845 792 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 AMNQ9BXJ7 453 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 UBN1Q9NPG3 1134 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ZFP69BQ9UJL9 534 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 PI4K2BG5E9Z4 385 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CBWD6Q4V339 395 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 MDH1BQ5I0G3 518 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CBWD3Q5JTY5 395 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CBWD5Q5RIA9 395 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 WLSQ5T9L3 541 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 SH3GL3Q99963 347 aa16.35■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 GSTA1P08263 222 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ZNF543Q08ER8 600 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 EPHA7Q15375 998 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms