RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257290.9

PDGFRA-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRA, Length 6,576 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRA-201ENST00000257290 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 KRT1P04264 644 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 ITGALP20701 1170 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 CUL4AQ13619 759 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 WASHC2DQ5SRD0 308 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 KIF2BQ8N4N8 673 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 BTG4Q9NY30 223 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 PTPRMP28827 1452 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 CCRL2O00421 344 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 ZBTB39O15060 712 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 GNAQP50148 359 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 GNG2P59768 71 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 COTL1Q14019 142 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 SQLEQ14534 574 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 ARID5BQ14865 1188 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 ANO1Q5XXA6 986 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 STK32AQ8WU08 396 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 KLHL4Q9C0H6 718 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 A0A1W2PQ72 361 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 NBNO60934 754 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 CPA3P15088 417 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 SLCO1A2P46721 670 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 CD97P48960 835 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 CCT3P49368 545 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 STX5Q13190 355 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 SEMA3AQ14563 771 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 LPIN1Q14693 890 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 OLFM1Q99784 485 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 RRN3Q9NYV6 651 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 RNF14Q9UBS8 474 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.15□□□□□ -1.26
PDGFRA-201ENST00000257290 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 ZW10O43264 779 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 RTN2O75298 545 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 KRT18P05783 430 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 GJC1P36383 396 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 UGP2Q16851 508 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF790Q6PG37 636 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 AKAP14Q86UN6 197 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 DTX3LQ8TDB6 740 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 BORCS6Q96GS4 357 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 CHID1Q9BWS9 393 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 TEX13BQ9BXU2 312 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 SNX25Q9H3E2 840 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 EPB41L5Q9HCM4 733 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 FANCFQ9NPI8 374 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 CFAP69A5D8W1 941 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 VWA5AO00534 786 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 BNC1Q01954 994 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 STK11Q15831 433 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 PPP2R5EQ16537 467 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC2A7Q6PXP3 512 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 WASF1Q92558 559 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 CNDP1Q96KN2 507 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 BOLA2Q9H3K6 86 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 STRIP2Q9ULQ0 834 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 TNNQ9UQP3 1299 aa7.15□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF521Q96K83 1311 aa7.14□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 DIP2AQ14689 1571 aa7.14□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 SSX5O60225 188 aa7.14□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 KRT15P19012 456 aa7.14□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 FGFR2P21802 821 aa7.14□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 ACAP1Q15027 740 aa7.14□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 CLUL1Q15846 466 aa7.14□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.14□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa7.14□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 KLHL31Q9H511 634 aa7.14□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7.14□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.14□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.14□□□□□ -1.27
PDGFRA-201ENST00000257290 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms