RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olig1Q9JKN5 260 aa10.01□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tnfrsf10bQ9QZM4 381 aa10.01□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Morc1Q9WVL5 950 aa10.01□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PhipQ8VDD9 1821 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Svs3aF2Z472 265 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm9857F7CXR1 130 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Btg4O70552 250 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Men1O88559 611 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mov10P23249 1004 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lta4hP24527 611 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 H2afxP27661 143 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hps5P59438 1126 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Casp7P97864 303 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tcp11Q01755 566 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tfdp1Q08639 410 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atp8b1Q148W0 1251 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Eepd1Q3TGW2 569 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MaeaQ4VC33 396 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atp13a4Q5XF90 1193 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gpbp1l1Q6NZP2 473 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Xpnpep1Q6P1B1 623 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fgd5Q80UZ0 1219 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Spata7Q80VP2 582 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc38a7Q8BWH0 463 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NkrfQ8BY02 690 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lmo3Q8BZL8 145 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klhl11Q8CE33 709 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 H6pdQ8CFX1 789 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr805Q8VFI4 319 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Polr3fQ921X6 316 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc12a9Q99MR3 914 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dis3Q9CSH3 958 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smco2Q9DA21 347 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Capn10Q9ESK3 666 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf25Q9QZR0 456 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tnfsf13bQ9WU72 309 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc12a7Q9WVL3 1083 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ncor1Q60974 2453 aa10□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DohhA0A1Y7VJ29 135 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm13084A2A8N0 494 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klhdc7aA2APT9 773 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc152E9PX14 254 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyth3O08967 399 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ess2O70279 479 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nptx2O70340 429 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stra6O70491 670 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MycP01108 439 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 H2afzP0C0S6 128 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ZfxP17012 799 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Phka1P18826 1241 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nkx2-5P42582 318 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AdssP46664 456 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SqleP52019 572 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hmgcs2P54869 508 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Psmb7P70195 277 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CiitaP79621 1155 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Etv6P97360 485 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf113a2Q14B01 337 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 H2afvQ3THW5 128 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PomkQ3TUA9 349 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nat8lQ3UGX3 299 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rapgef1Q3UHC1 1224 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem232Q5K6N0 675 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mapk6Q61532 720 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sh3gl1Q62419 368 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 KaznQ69ZS8 779 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ncapg2Q6DFV1 1138 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Styk1Q6J9G1 429 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krit1Q6S5J6 736 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nucks1Q80XU3 234 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc13a4Q8BZ82 625 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrpl58Q8R035 206 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Uap1Q91YN5 522 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Psmd6Q99JI4 389 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ppp1r3aQ99MR9 1089 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lrrc57Q9D1G5 239 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Spata17Q9D552 379 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Drap1Q9D6N5 205 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Llcfc1Q9D9P8 108 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ggps1Q9WTN0 300 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pds5aQ6A026 1332 aa9.99□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm7086A0A1W2P766 342 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm21973F6WEZ7 68 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nck2O55033 380 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcbp1P60335 356 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trim43aQ3TL54 445 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Btg1-ps1Q3V0S2 161 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Btg1-ps2Q3V0X0 161 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 RetsatQ64FW2 609 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pla2g4cQ64GA5 597 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Antxr2Q6DFX2 487 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acot5Q6Q2Z6 421 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf507Q6ZPY5 941 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Actn1Q7TPR4 892 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nacc1Q7TSZ8 514 aa9.98□□□□□ -0.81
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bola2Q8BGS2 86 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.4 ms