RNA–Protein interactions for RNA: YKR093W

PTR2, Transcript of Integral membrane peptide transporter, yeast

Gene PTR2, Length 1,806 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PTR2	YKR093W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	ERV2	Q12284	196 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	MRX3	P38172	270 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	RCK1	P38622	512 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	PET8	P38921	284 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	VAC7	P53950	1165 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	CRZ1	P53968	678 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	SCS7	Q03529	384 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	RSA1	Q08932	381 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	REV1	P12689	985 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	RPO26	P20435	155 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	PBN1	P25580	416 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	YAT2	P40017	923 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	TPC1	P53257	314 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	FSH2	Q05015	223 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	SPO77	Q06134	477 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	GAS2	Q06135	555 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	PPT2	Q12036	173 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	SFM1	Q12314	213 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	HMS1	Q12398	434 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	INO2	P26798	304 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	PPA2	P28239	310 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	YER184C	P39961	794 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	ATG18	P43601	500 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	PBA1	Q05778	276 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	SNF8	Q12483	233 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	DAL81	P21657	970 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	YKL187C	P34231	750 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	SDS24	P38314	527 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	GLG2	P47011	380 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	CRH1	P53301	507 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	SLT2	Q00772	484 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	SFH1	Q06168	426 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	COQ1	P18900	473 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	ZRC1	P20107	442 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	YFR057W	P43625	151 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	HOC1	P47124	396 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	PEX31	P53203	462 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	FDH1	Q08911	376 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	CSM4	Q08955	156 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	JID1	Q12350	301 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	IZH2	Q12442	317 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	LDS1	P31379	325 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	ATG12	P38316	186 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	ASG7	P46993	209 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	TPN1	P53099	579 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	BNA7	Q04066	261 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	PEX30	Q06169	523 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	CTR3	Q06686	241 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	RAD51	P25454	400 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	MAL32	P38158	584 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	BIR1	P47134	954 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	IBA57	P47158	497 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	MAL12	P53341	584 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	GMC1	Q04399	608 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	PEP1	P32319	1579 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	GIT1	P25346	518 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	URA10	P30402	227 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	YBR062C	P38239	180 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	PAN6	P40459	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	REE1	P40893	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	MHP1	P43638	1398 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	RPC17	P47076	161 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	DPP1	Q05521	289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	DCR2	Q05924	578 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	MIM1	Q08176	113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	TIP41	Q12199	356 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	TRM732	Q03496	1420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	PHO2	P07269	559 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTR2	YKR093W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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