RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL050CYKL050C ITR2P30606 609 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C COX13P32799 129 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C MRPL6P32904 214 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C APL3P38065 1025 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C PYK2P52489 506 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C CPD1P53314 239 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C YPR003CP53394 754 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C IBD2P53892 351 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C HER2Q03557 464 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C RIF2Q06208 395 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C YOL019WQ08157 551 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C YKL033W-AQ86ZR7 236 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C YOR338WQ99326 363 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C IRA1P18963 3092 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C KIN3P22209 435 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C SAC1P32368 623 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C FKS1P38631 1876 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C YJR054WP47114 497 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C UBC11P52492 156 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C SNO1Q03144 224 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C PFA5Q03289 374 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C ROT1Q03691 256 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C DLT1Q04216 342 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C VBA1Q04301 562 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C ACF2Q12168 779 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C RKI1Q12189 258 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C SET6Q12529 373 aa3.36□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C TPK3P05986 398 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C RAD52P06778 471 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C DPM1P14020 267 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C DCC1P25559 380 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C EHD3P28817 500 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C ZRT1P32804 376 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C YTP1P53584 459 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C RCF2P53721 224 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C GPI15P53961 229 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C NUP49Q02199 472 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C MHR1Q06630 226 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C POM33Q12164 279 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C MYO1P08964 1928 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C SIR3P06701 978 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data3.35□□□□□ -1.87not detected
YKL050CYKL050C TKL1P23254 680 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C MBR1P23493 339 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C YCR102CP25608 368 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C ATO2P32907 282 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C CLG1P35190 452 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C IST2P38250 946 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C SSH1P38353 490 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C SEN34P39707 275 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C RBG1P39729 369 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C COS4P43542 379 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C PRY1P47032 299 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C MOG1P47123 218 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C YJR079WP47126 109 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C JHD2P47156 728 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C TIS11P47977 285 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C SEC13Q04491 297 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C SFM1Q12314 213 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C RKM5Q12367 367 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C RAD50P12753 1312 aa3.35□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C MES1P00958 751 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C ASP3-2P0CX77 362 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C ASP3-3P0CX78 362 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C ASP3-4P0CX79 362 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C ASP3-1P0CZ17 362 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C AMD1P15274 810 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C TCA17P32613 152 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C YKL063CP35725 167 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C YER137CP40083 148 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C YIA6P40556 373 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C IRC24P40580 263 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C ASG7P46993 209 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C ALB1P47019 175 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C USE1P53146 245 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C LST7P53237 242 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C YGR151CP53287 111 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C GTR2P53290 341 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C CAF40P53829 373 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C ARC18Q05933 178 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C YNG1Q08465 219 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C YLR049CQ12110 428 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C IZH4Q99393 312 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C HEM2P05373 342 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C SNF3P10870 884 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C ECM15P35195 104 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C UPS2P35200 230 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C YHR035WP38769 630 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C DHH1P39517 506 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C FAA2P39518 744 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C BDH2P39713 417 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C MUP1P50276 574 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C MMS2P53152 137 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C YNR066CP53752 436 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C ABF2Q02486 183 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C RMI1Q02685 241 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C TRM82Q03774 444 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.7 ms