RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGMS1-211ENST00000626236 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM40Q8WWA1 233 aa9.37□□□□□ -0.91
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SGMS1-211ENST00000626236 SYN1P17600 705 aa9.34□□□□□ -0.91
SGMS1-211ENST00000626236 ITGB8P26012 769 aa9.34□□□□□ -0.91
SGMS1-211ENST00000626236 RFC2P35250 354 aa9.34□□□□□ -0.91
SGMS1-211ENST00000626236 HOXD13P35453 343 aa9.34□□□□□ -0.91
SGMS1-211ENST00000626236 PRCPP42785 496 aa9.34□□□□□ -0.91
SGMS1-211ENST00000626236 LIG4P49917 911 aa9.34□□□□□ -0.91
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