RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 CDR2Q01850 454 aa21.5■■□□□ 1.03
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CTDP1-208ENST00000613122 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 CTSHP09668 335 aa21.5■■□□□ 1.03
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CTDP1-208ENST00000613122 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 HUNKP57058 714 aa21.5■■□□□ 1.03
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CTDP1-208ENST00000613122 CCL15Q16663 113 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.5■■□□□ 1.03
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CTDP1-208ENST00000613122 SLC25A27O95847 323 aa21.5■■□□□ 1.03
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CTDP1-208ENST00000613122 TMEM247A6NEH6 219 aa21.49■■□□□ 1.03
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CTDP1-208ENST00000613122 TADA2BQ86TJ2 420 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 EFHD1Q9BUP0 239 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 SIK2Q9H0K1 926 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 H3BRJ5 948 aa21.49■■□□□ 1.03
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CTDP1-208ENST00000613122 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.47■■□□□ 1.03
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CTDP1-208ENST00000613122 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.47■■□□□ 1.03
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CTDP1-208ENST00000613122 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.47■■□□□ 1.03
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CTDP1-208ENST00000613122 RGL1Q9NZL6 768 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 ATP8B1O43520 1251 aa21.46■■□□□ 1.03
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CTDP1-208ENST00000613122 TRIM49P0CI25 452 aa21.46■■□□□ 1.03
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