RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 LIG1P18858 919 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 NRIP1P48552 1158 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 RARRES1P49788 294 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 NDUFV1P49821 464 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM189BP81408 668 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 HYAL1Q12794 435 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM132AQ24JP5 1023 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 NAALADL2Q58DX5 795 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PLPP4Q5VZY2 271 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 HAUS3Q68CZ6 603 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 SPPL3Q8TCT6 385 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 ASAP3Q8TDY4 903 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CPB2Q96IY4 423 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 HSD17B14Q9BPX1 270 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 APOL6Q9BWW8 343 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CWH43Q9H720 699 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 MINDY3Q9H8M7 445 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 IFT122Q9HBG6 1241 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TUFT1Q9NNX1 390 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 GPRC5CQ9NQ84 441 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TLR9Q9NR96 1032 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CHST12Q9NRB3 414 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 ANKEF1Q9NU02 776 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM105AQ9NUU6 356 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 XIRP2A4UGR9 3374 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 BRWD1Q9NSI6 2320 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 MEIS3P2A8K0S8 358 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC01565O15544 149 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 LYPLA2O95372 231 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 EOMESO95936 686 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 SKIP12755 728 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 IL9P15248 144 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TRAPPC10P48553 1259 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 RAB27AP51159 221 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CAPSQ13938 189 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNT2Q6UVM3 1135 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 GLB1LQ6UWU2 654 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRC55Q6ZSA7 311 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CATSPER3Q86XQ3 398 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PER2O15055 1255 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 ASAP2O43150 1006 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PPM1AP35813 382 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 MCM2P49736 904 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PTPN5P54829 565 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PTGDRQ13258 359 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CAMK2BQ13554 666 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CAMK1Q14012 370 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 LEXMQ3ZCV2 418 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 THSD4Q6ZMP0 1018 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 URGCPQ8TCY9 931 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 SNX29Q8TEQ0 813 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PGBD4Q96DM1 585 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 NACC1Q96RE7 527 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TCF25Q9BQ70 676 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 RAB34Q9BZG1 259 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TLE6Q9H808 572 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 SPG21Q9NZD8 308 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 LRWD1Q9UFC0 647 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CUL9Q8IWT3 2517 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 PP2D1A8MPX8 630 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 TSPAN1O60635 241 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 TBX10O75333 385 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 GLRA2P23416 452 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 BCAR1P56945 870 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 PTENP60484 403 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 ERVFC1P60507 584 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 KRT17Q04695 432 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 UBE3AQ05086 875 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 NOMO2Q5JPE7 1267 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 LLGL2Q6P1M3 1020 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 NOTUMQ6P988 496 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 PADI6Q6TGC4 694 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms