RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587623.1

CTDP1-204, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDP1, Length 435 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-204ENST00000587623 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 GATMP50440 423 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 PEX3P56589 373 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 STRN3Q13033 797 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 SLC39A14Q15043 492 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 AAK1Q2M2I8 961 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 LONRF3Q496Y0 759 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 RINT1Q6NUQ1 792 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 SLC27A1Q6PCB7 646 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 GPBP1Q86WP2 473 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 P2RX5Q93086 422 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 CPB2Q96IY4 423 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 USP28Q96RU2 1077 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 APOL6Q9BWW8 343 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 RSAD1Q9HA92 442 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 ARID2Q68CP9 1835 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 MYO7AQ13402 2215 aa9.6□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 C5orf67F2Z3F1 127 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 ACKR2O00590 384 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 NCK2O43639 380 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 NPTXRO95502 500 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 YEATS4O95619 227 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 F13A1P00488 732 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 PLCG1P19174 1290 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 SCP2P22307 547 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 GUCY2CP25092 1073 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 ABCD1P33897 745 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 STAT6P42226 847 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 NASPP49321 788 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 UBE3AQ05086 875 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 KARSQ15046 597 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 PTPAQ15257 358 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 FAM187BQ17R55 369 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 C1orf186Q6ZWK4 172 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 SV2BQ7L1I2 683 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 SPRED2Q7Z698 418 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 RAD54LQ92698 747 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 LPPQ93052 612 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 CASD1Q96PB1 797 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 PNMA5Q96PV4 448 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 TCHPQ9BT92 498 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 GBP3Q9H0R5 595 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 POLD4Q9HCU8 107 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 SPG21Q9NZD8 308 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 THEGQ9P2T0 379 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 STK17AQ9UEE5 414 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 PARP2Q9UGN5 583 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDP1-204ENST00000587623 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 PPP6R2O75170 966 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 CSPG5O95196 566 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 PLS3P13797 630 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 CA8P35219 290 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 DDIT3P35638 169 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 NPTX2P47972 431 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 ME1P48163 572 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 SLC12A3P55017 1021 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 MCM6Q14566 821 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 SPECC1Q5M775 1068 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 KCNT2Q6UVM3 1135 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 KCNK18Q7Z418 384 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 MYCT1Q8N699 235 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.58□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 SPIRE2Q8WWL2 714 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms