RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587167.1

SPHK1-204, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SPHK1, Length 456 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-204ENST00000587167 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
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SPHK1-204ENST00000587167 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
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SPHK1-204ENST00000587167 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
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SPHK1-204ENST00000587167 ODR4Q5SWX8 454 aa21.6■■□□□ 1.05
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SPHK1-204ENST00000587167 FAM13AO94988 1023 aa21.59■■□□□ 1.05
SPHK1-204ENST00000587167 AMHP03971 560 aa21.59■■□□□ 1.05
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SPHK1-204ENST00000587167 DEPTORQ8TB45 409 aa21.59■■□□□ 1.05
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SPHK1-204ENST00000587167 ZHX3Q9H4I2 956 aa21.59■■□□□ 1.05
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SPHK1-204ENST00000587167 INSL6Q9Y581 213 aa21.59■■□□□ 1.05
SPHK1-204ENST00000587167 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
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SPHK1-204ENST00000587167 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
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SPHK1-204ENST00000587167 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
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SPHK1-204ENST00000587167 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.58■■□□□ 1.05
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SPHK1-204ENST00000587167 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.58■■□□□ 1.05
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SPHK1-204ENST00000587167 KMT5AQ9NQR1 393 aa21.58■■□□□ 1.05
SPHK1-204ENST00000587167 COL4A6Q14031 1691 aa21.57■■□□□ 1.04
SPHK1-204ENST00000587167 TTC3P53804 2025 aa21.57■■□□□ 1.04
SPHK1-204ENST00000587167 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.57■■□□□ 1.04
SPHK1-204ENST00000587167 ZNF131P52739 623 aa21.57■■□□□ 1.04
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SPHK1-204ENST00000587167 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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SPHK1-204ENST00000587167 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
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SPHK1-204ENST00000587167 TOP1MTQ969P6 601 aa21.56■■□□□ 1.04
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SPHK1-204ENST00000587167 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.56■■□□□ 1.04
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SPHK1-204ENST00000587167 KCNG1Q9UIX4 513 aa21.56■■□□□ 1.04
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SPHK1-204ENST00000587167 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SPHK1-204ENST00000587167 SFR1Q86XK3 245 aa21.54■■□□□ 1.04
SPHK1-204ENST00000587167 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.54■■□□□ 1.04
SPHK1-204ENST00000587167 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SPHK1-204ENST00000587167 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SPHK1-204ENST00000587167 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.54■■□□□ 1.04
SPHK1-204ENST00000587167 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.54■■□□□ 1.04
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