RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 C4orf32Q8N8J7 132 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 GBP3Q9H0R5 595 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 CWH43Q9H720 699 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 GPRC5CQ9NQ84 441 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 RNF19AQ9NV58 838 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 TNFRSF10AO00220 468 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF623O75123 536 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 ITGA4P13612 1032 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 LIG1P18858 919 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 CYP11B2P19099 503 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 MUTP22033 750 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJB1P25685 340 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 CDC25AP30304 524 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 AXLP30530 894 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 IRS1P35568 1242 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 PPM1AP35813 382 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 PBX3P40426 434 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 POU5F1BQ06416 359 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 HYAL1Q12794 435 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 CAPSQ13938 189 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 CAMK1Q14012 370 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 LEXMQ3ZCV2 418 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 TMC7Q7Z402 723 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 CNNM3Q8NE01 707 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 URGCPQ8TCY9 931 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 CPB2Q96IY4 423 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 IFT74Q96LB3 600 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 TCF25Q9BQ70 676 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 TLE6Q9H808 572 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 RSAD1Q9HA92 442 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 POLD4Q9HCU8 107 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 TLR9Q9NR96 1032 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 SPG21Q9NZD8 308 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 DNM3Q9UQ16 869 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 VWA3AA6NCI4 1184 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 MEIS3P2A8K0S8 358 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 PP2D1A8MPX8 630 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 PER2O15055 1255 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 TSPAN1O60635 241 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 OFD1O75665 1012 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 POMCP01189 267 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 PDCP20941 246 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 PRPHP41219 470 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 NRIP1P48552 1158 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFV1P49821 464 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 BCAR1P56945 870 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 ERVFC1P60507 584 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 PLCB3Q01970 1234 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 PPP2R5AQ15172 486 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 CLUL1Q15846 466 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 ECM1Q16610 540 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 PLPP4Q5VZY2 271 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 HACE1Q8IYU2 909 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 IGSF22Q8N9C0 903 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 DEPTORQ8TB45 409 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 RSPH1Q8WYR4 309 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM169Q96HH4 297 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 PLIN2Q99541 437 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 APOL6Q9BWW8 343 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 CSRNP2Q9H175 543 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 FAM50BQ9Y247 325 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC169A6NNP5 214 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRM-214ENST00000583153 E9PMD0 336 aa9.2□□□□□ -0.94
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