RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580813.1

VNN3-214, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 5

Gene VNN3, Length 558 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-214ENST00000580813 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.9□□□□□ -1.3
VNN3-214ENST00000580813 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.9□□□□□ -1.3
VNN3-214ENST00000580813 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.9□□□□□ -1.3
VNN3-214ENST00000580813 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.9□□□□□ -1.3
VNN3-214ENST00000580813 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.9□□□□□ -1.3
VNN3-214ENST00000580813 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.9□□□□□ -1.3
VNN3-214ENST00000580813 FERMT2Q96AC1 680 aa6.9□□□□□ -1.3
VNN3-214ENST00000580813 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
VNN3-214ENST00000580813 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
VNN3-214ENST00000580813 TMEM260Q9NX78 707 aa6.9□□□□□ -1.3
VNN3-214ENST00000580813 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 RHOBTB3O94955 611 aa6.89□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 F2P00734 622 aa6.89□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.89□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.89□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.89□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 EFHBQ8N7U6 833 aa6.89□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.89□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 MSRAQ9UJ68 235 aa6.89□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.89□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 DNAJC6O75061 913 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 PPFIA4O75335 1185 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 LY86O95711 162 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 GYPEP15421 78 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 LRRC32Q14392 662 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 FAM83AQ86UY5 434 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 TRIM24O15164 1050 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 NUDT3O95989 172 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 PROZP22891 400 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 PTTG1IPP53801 180 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 DSG1Q02413 1049 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 KIF18BQ86Y91 864 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 IL17RAQ96F46 866 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 LAG3P18627 525 aa6.86□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 DUSP2Q05923 314 aa6.86□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 VPS72Q15906 364 aa6.86□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.86□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.86□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 GAB3Q8WWW8 586 aa6.86□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.86□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 KCNH6Q9H252 994 aa6.86□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.86□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 GZMKP49863 264 aa6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 TCEA2Q15560 299 aa6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 METTL24Q5JXM2 366 aa6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 XYLT1Q86Y38 959 aa6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 NDC1Q9BTX1 674 aa6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 MTFR1LQ9H019 292 aa6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.85□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 LCHNA4D1U4 455 aa6.84□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 AHRRA9YTQ3 701 aa6.84□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 TGM5O43548 720 aa6.84□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 B3GALT2O43825 422 aa6.84□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 NRP2O60462 931 aa6.84□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 PFKMP08237 780 aa6.84□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 ADRA1BP35368 520 aa6.84□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 WNT3AP56704 352 aa6.84□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 MGAT5Q09328 741 aa6.84□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.84□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.84□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.84□□□□□ -1.31
VNN3-214ENST00000580813 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
VNN3-214ENST00000580813 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
VNN3-214ENST00000580813 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
VNN3-214ENST00000580813 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
VNN3-214ENST00000580813 NRG3P56975 720 aa6.83□□□□□ -1.32
VNN3-214ENST00000580813 FAM189BP81408 668 aa6.83□□□□□ -1.32
VNN3-214ENST00000580813 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.83□□□□□ -1.32
VNN3-214ENST00000580813 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.83□□□□□ -1.32
VNN3-214ENST00000580813 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.83□□□□□ -1.32
VNN3-214ENST00000580813 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms