RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.7■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 M0QYV0 167 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 RASSF3Q86WH2 238 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 CIITAP33076 1130 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 SRLQ86TD4 932 aa22.69■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 TRIM33Q9UPN9 1127 aa22.69■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC6O75061 913 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 RNF217Q8TC41 542 aa22.69■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 CSPG5O95196 566 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 TDP2O95551 362 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 CYP27B1O15528 508 aa22.68■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 DPF2Q92785 391 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 FAM196BA6NMK8 535 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 SATB2Q9UPW6 733 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP10A1A4S6 786 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 H3BRJ5 948 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB22O15209 634 aa22.68■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 MASTLQ96GX5 879 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 KRT76Q01546 638 aa22.68■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 COG1Q8WTW3 980 aa22.67■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 GGPS1O95749 300 aa22.67■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM161BQ96MY7 647 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.67■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 PHKA2P46019 1235 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 GUCY1A2P33402 732 aa22.66■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 SDC4P31431 198 aa22.66■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 RMDN2Q96LZ7 410 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 LXNQ9BS40 222 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 ETNK1Q9HBU6 452 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM49P0CI25 452 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM49CP0CI26 452 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 CD209Q9NNX6 404 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 KRT7P08729 469 aa22.66■■□□□ 1.22
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