RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569270.5

CHTF18-218, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 711 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-218ENST00000569270 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 IGSF21Q96ID5 467 aa21.54■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 A0A087WWV3 80 aa21.53■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 LYPLA2O95372 231 aa21.53■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 SLC11A1P49279 550 aa21.53■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 EDAQ92838 391 aa21.53■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 MTMR9Q96QG7 549 aa21.53■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 ZBP1Q9H171 429 aa21.53■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 RSAD1Q9HA92 442 aa21.53■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 ANKEF1Q9NU02 776 aa21.53■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.53■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 CARNS1A5YM72 827 aa21.52■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.52■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 B4GALT3O60512 393 aa21.52■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 TSPAN1O60635 241 aa21.52■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 MCM7P33993 719 aa21.52■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 TFDP1Q14186 410 aa21.52■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.52■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.52■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.52■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.52■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.52■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.52■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 CDH22Q9UJ99 828 aa21.52■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.52■■□□□ 1.04
CHTF18-218ENST00000569270 POTEMA6NI47 508 aa21.51■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 DGAT1O75907 488 aa21.51■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 DDHD2O94830 711 aa21.51■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 POMCP01189 267 aa21.51■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 RARRES1P49788 294 aa21.51■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 PTENP60484 403 aa21.51■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 CPB2Q96IY4 423 aa21.51■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.51■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 CTSAP10619 480 aa21.5■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 ITGA4P13612 1032 aa21.5■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 ARL2P36404 184 aa21.5■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 CAPSQ13938 189 aa21.5■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 CES5AQ6NT32 575 aa21.5■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 C8orf76Q96K31 380 aa21.5■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.5■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 ADAM7Q9H2U9 754 aa21.5■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.5■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.5■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 IPPQ9Y573 584 aa21.5■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 ALDH2P05091 517 aa21.49■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.037e-16■■■□□ 18.8
CHTF18-218ENST00000569270 NOTUMQ6P988 496 aa21.49■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.49■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.49■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 CNNM3Q8NE01 707 aa21.49■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 RNF39Q9H2S5 420 aa21.49■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.49■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 HES2Q9Y543 173 aa21.49■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 WEE2P0C1S8 567 aa21.48■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 EPCAMP16422 314 aa21.48■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 GLRA2P23416 452 aa21.48■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 AXLP30530 894 aa21.48■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 ZXDAP98168 799 aa21.48■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.48■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 GIT2Q14161 759 aa21.48■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 CCDC51Q96ER9 411 aa21.48■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.48■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.48■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 APOL6Q9BWW8 343 aa21.48■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 CSRNP2Q9H175 543 aa21.48■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 UBN1Q9NPG3 1134 aa21.48■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 IRAK3Q9Y616 596 aa21.48■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 TMEM221A6NGB7 291 aa21.47■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 M0R296 226 aa21.47■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 NRP1O14786 923 aa21.47■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.47■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 MLH1P40692 756 aa21.47■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 ITIH3Q06033 890 aa21.47■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 POU5F1BQ06416 359 aa21.47■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 PTPN14Q15678 1187 aa21.47■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 ZNF174Q15697 407 aa21.47■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 AMHR2Q16671 573 aa21.47■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 KANK3Q6NY19 840 aa21.47■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.47■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 GAD1Q99259 594 aa21.47■■□□□ 1.03
CHTF18-218ENST00000569270 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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