RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561436.1

HERC1-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, human

TSL 4

Gene HERC1, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC1-215	ENST00000561436	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	RICTOR	Q6R327	1708 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436		K7ESM1	405 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	PLAT	P00750	562 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	RBP3	P10745	1247 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	ENPP1	P22413	925 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	ECE1	P42892	770 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	BCAR1	P56945	870 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	ACAP1	Q15027	740 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	ACAP2	Q15057	778 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	TBR1	Q16650	682 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	UGT8	Q16880	541 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	GGT6	Q6P531	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	A2M	P01023	1474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	MED14	O60244	1454 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	NLRP1	Q9C000	1473 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	MIA2	Q96PC5	1412 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	TNR	Q92752	1358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	TNKS	O95271	1327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	LCHN	A4D1U4	455 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	AKAP10	O43572	662 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	PRL	P01236	227 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	ITGB3	P05106	788 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	RGS3	P49796	1198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	RAB27A	P51159	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	SLC5A3	P53794	718 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HERC1-215	ENST00000561436	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HERC1-215	ENST00000561436	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HERC1-215	ENST00000561436	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HERC1-215	ENST00000561436	GPR42	O15529	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HERC1-215	ENST00000561436	TSPAN6	O43657	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HERC1-215	ENST00000561436	NRP2	O60462	931 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HERC1-215	ENST00000561436	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HERC1-215	ENST00000561436	HMGCR	P04035	888 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HERC1-215	ENST00000561436	TSPY4	P0CV99	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HERC1-215	ENST00000561436	TSPY10	P0CW01	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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