RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553570.5

ATXN3-222, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 757 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-222	ENST00000553570	SSPN	Q14714	243 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	GORAB	Q5T7V8	394 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	MBLAC2	Q68D91	279 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	LDHD	Q86WU2	507 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	CCDC103	Q8IW40	242 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	PTPRN2	Q92932	1015 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	MFSD3	Q96ES6	412 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	MTA3	Q9BTC8	594 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	MXD3	Q9BW11	206 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	SPC25	Q9HBM1	224 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	CLEC1B	Q9P126	229 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	UTY	O14607	1347 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	RTL9	Q8NET4	1388 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	SHTN1	A0MZ66	631 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	YDJC	A8MPS7	323 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	EYA2	O00167	538 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	CYBB	P04839	570 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	GLI4	P10075	376 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	KLRK1	P26718	216 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	MAPKAPK2	P49137	400 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	ATP8B2	P98198	1209 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	NR1I3	Q14994	352 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	TESK1	Q15569	626 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	PTPRO	Q16827	1216 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	TMC6	Q7Z403	805 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	MZB1	Q8WU39	189 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	DCAF4	Q8WV16	495 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	SCLY	Q96I15	445 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	KCTD3	Q9Y597	815 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	COL4A5	P29400	1685 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570	LTBP1	Q14766	1721 aa		5.71	□□□□□ -1.49
ATXN3-222	ENST00000553570		A0A087X0B3	334 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	C7orf72	A4D263	438 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	PDE8B	O95263	885 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC5A1	P13866	664 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	PAM	P19021	973 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	TIMM10	P62072	90 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	TFCP2	Q12800	502 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	UBE4A	Q14139	1066 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	BRAP	Q7Z569	592 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	MMP19	Q99542	508 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	COA1	Q9GZY4	146 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	CD209	Q9NNX6	404 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570		A0A1W2PQ27	194 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570		A0A1W2PQ64	194 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570		A0A1W2PQC6	194 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570		A0A1W2PQD8	194 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-222	ENST00000553570	NUAK1	O60285	661 aa		5.7	□□□□□ -1.5

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