RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 SOX11P35716 441 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 COG2Q14746 738 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 FGD2Q7Z6J4 655 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 TRIM69Q86WT6 500 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 RHOT2Q8IXI1 618 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 LPIN2Q92539 896 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 XAGE2Q96GT9 111 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 FAM192AQ9GZU8 254 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 NDST4Q9H3R1 872 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 CLIC2O15247 247 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 LRPAP1P30533 357 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 CHRNA3P32297 505 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 AOC3Q16853 763 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 SNX30Q5VWJ9 437 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 CNDP1Q96KN2 507 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 KLHL2O95198 593 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 ARMC4Q5T2S8 1044 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 TRIM74Q86UV6 250 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 TRIM73Q86UV7 250 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 SLFN12Q8IYM2 578 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 BTN2A2Q8WVV5 523 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 OSBPL8Q9BZF1 889 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 HESX1Q9UBX0 185 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF180Q9UJW8 692 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 A0A0D9SFI3 127 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 CYTH3O43739 400 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 PAMP19021 973 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 PMLP29590 882 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 KDM7AQ6ZMT4 941 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 G2E3Q7L622 706 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 CD209Q9NNX6 404 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 RCOR1Q9UKL0 485 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 DGKIO75912 1065 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 GPS1Q13098 491 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 MDM1Q8TC05 714 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 SEL1LQ9UBV2 794 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 POU5F1BQ06416 359 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 STAT4Q14765 748 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 DCLRE1BQ9H816 532 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.13□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 ARPC4P59998 168 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 SNAP25P60880 206 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 COX10Q12887 443 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 ITGADQ13349 1161 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 CUL4AQ13619 759 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 LRRC49Q8IUZ0 686 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 AMACRQ9UHK6 382 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 LCMT1Q9UIC8 334 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 PRPSAP2O60256 369 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 ARL4AP40617 200 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 TP53BP2Q13625 1128 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 LRRC34Q8IZ02 419 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 ABHD8Q96I13 439 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 GINS2Q9Y248 185 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 SEMA3EO15041 775 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 RGS20O76081 388 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 V9GYQ6 96 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 LRRC53A6NM62 1247 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 PGM3O95394 542 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 RAPGEF3O95398 923 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 TCF3P15923 654 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 RESTQ13127 1097 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 CHID1Q9BWS9 393 aa9.12□□□□□ -0.95
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF556Q9HAH1 456 aa9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms