RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 KPNA6O60684 536 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 RHOBTB3O94955 611 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 GCP02774 474 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 GYPEP15421 78 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 TGM1P22735 817 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 NR4A1P22736 598 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 NEK4P51957 841 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 METTL24Q5JXM2 366 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 KCNV1Q6PIU1 500 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 OR5M3Q8NGP4 307 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 MLST8Q9BVC4 326 aa7.12□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 BMP5P22003 454 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 WNT3AP56704 352 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 DSG1Q02413 1049 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 CD69Q07108 199 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 TCEA2Q15560 299 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 NXPE1Q8N323 547 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 MSRAQ9UJ68 235 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 NRP2O60462 931 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 DNAJC6O75061 913 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 LY86O95711 162 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 CASRP41180 1078 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 FAM83AQ86UY5 434 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 IL17RAQ96F46 866 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 HDAC5Q9UQL6 1122 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 PCSK5Q92824 1860 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 PFKMP08237 780 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 PROZP22891 400 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 GPR15P49685 360 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 TIGD2Q4W5G0 525 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 VRK3Q8IV63 474 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 PACSIN3Q9UKS6 424 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 USP18Q9UMW8 372 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 HS3ST4Q9Y661 456 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 CFBP00751 764 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 LAG3P18627 525 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 ADRA1BP35368 520 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 DUSP2Q05923 314 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 VPS72Q15906 364 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 CCDC178Q5BJE1 867 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 GPR158Q5T848 1215 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 IQSEC1Q6DN90 963 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 DOK3Q7L591 496 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 GAB3Q8WWW8 586 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 KCNH6Q9H252 994 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 TGM5O43548 720 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 B3GALT2O43825 422 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 GZMKP49863 264 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 NRG3P56975 720 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 SART3Q15020 963 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 HOMER1Q86YM7 354 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 SLC46A2Q9BY10 475 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 LMNAP02545 664 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 PHC1P78364 1004 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 OCRLQ01968 901 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 GPR150Q8NGU9 434 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 NDC1Q9BTX1 674 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 MTFR1LQ9H019 292 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 GRID2IPA4D2P6 1211 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 FAM83GA6ND36 823 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 AHRRA9YTQ3 701 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 NUDT3O95989 172 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 LSP1P33241 339 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 MGAT5Q09328 741 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 CCDC144BQ3MJ40 725 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 GLB1L2Q8IW92 636 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-211ENST00000522045 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
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