RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518136.3

HOXA13-202, Transcript of homeobox A13, humanhuman

TSL 2

Gene HOXA13, Length 871 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-202ENST00000518136 CUEDC2Q9H467 287 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 MAGEF1Q9HAY2 307 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 ZNF302Q9NR11 478 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 NRBP1Q9UHY1 535 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 TRIM17Q9Y577 477 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 ALPK3Q96L96 1907 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 TRIP11Q15643 1979 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 FRMD3A2A2Y4 597 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 SEPT4O43236 478 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 ADAMTS4O75173 837 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 AKR1A1P14550 325 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 SOX10P56693 466 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 BEX3Q00994 111 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 TYRO3Q06418 890 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 MORC3Q14149 939 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 GIT2Q14161 759 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 PLCB4Q15147 1175 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 DPCR1Q3MIW9 517 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 ISM2Q6H9L7 571 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 SV2BQ7L1I2 683 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 DYMQ7RTS9 669 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 PGBD3Q8N328 593 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 RAET1EQ8TD07 263 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 SH3TC2Q8TF17 1288 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 NACC1Q96RE7 527 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 FIZ1Q96SL8 496 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 REEP2Q9BRK0 252 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 DNM3Q9UQ16 869 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 PTPN22Q9Y2R2 807 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 ANK1P16157 1881 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 CDC14CA4D256 554 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 PGK1P00558 417 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 F2P00734 622 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 RPN1P04843 607 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 MARK3P27448 753 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 HOXD10P28358 340 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 STAT5BP51692 787 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 GJA9P57773 515 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 COASYQ13057 564 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 KANK3Q6NY19 840 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 LRSAM1Q6UWE0 723 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 KIAA0895Q8NCT3 520 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 BSNDQ8WZ55 320 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 ATP6V0A1Q93050 837 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 RUBCNLQ9H714 662 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 ANKEF1Q9NU02 776 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 GDAQ9Y2T3 454 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 Q9Y3F1 56 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 ARHGEF35A5YM69 484 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 CARNS1A5YM72 827 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 HAS3O00219 553 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 NOP56O00567 594 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 USO1O60763 962 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 RHOBTB3O94955 611 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 GUCY2CP25092 1073 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 GRK4P32298 578 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 CASP5P51878 434 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 ZNF131P52739 623 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 LBX1P52954 281 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 PRMT2P55345 433 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 ASIC1P78348 528 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 DRP2Q13474 957 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 DBN1Q16643 649 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 MTERF2Q49AM1 385 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 XKR9Q5GH70 373 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 XKR3Q5GH77 459 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 UNC13DQ70J99 1090 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms