RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 PLIN2Q99541 437 aa15.6■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 KIFC3Q9BVG8 833 aa15.6■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 RUSC1Q9BVN2 902 aa15.6■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 CSRNP2Q9H175 543 aa15.6■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 TBC1D13Q9NVG8 400 aa15.6■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 CLIC4Q9Y696 253 aa15.6■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 TTLL13PA6NNM8 815 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 BMP15O95972 392 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 NCLP19338 710 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 KCNA5P22460 613 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 NAMPTP43490 491 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 BCAR1P56945 870 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 ERVFC1P60507 584 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 UBE3AQ05086 875 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 COL19A1Q14993 1142 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 AAK1Q2M2I8 961 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 RINT1Q6NUQ1 792 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 C1orf186Q6ZWK4 172 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 DAW1Q8N136 415 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 DEPTORQ8TB45 409 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 RNF39Q9H2S5 420 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 FZD8Q9H461 694 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 USP20Q9Y2K6 914 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 HES2Q9Y543 173 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 IPPQ9Y573 584 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 ARID2Q68CP9 1835 aa15.59■□□□□ 0.09
PDGFRB-202ENST00000517488 A0A1B0GUA9 196 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 B4GALT3O60512 393 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 PLCB3Q01970 1234 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 TMEM119Q4V9L6 283 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 EP400NLQ6ZTU2 488 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 CABP7Q86V35 215 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF280BQ86YH2 543 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC39A11Q8N1S5 342 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 KIFAP3Q92845 792 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 IFT74Q96LB3 600 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 AK8Q96MA6 479 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 CCDC113Q9H0I3 377 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 C2orf40Q9H1Z8 148 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 IGFLR1Q9H665 355 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 RSAD1Q9HA92 442 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 TLR9Q9NR96 1032 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 SPG21Q9NZD8 308 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 MUC3AQ02505 3323 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 NLRC5Q86WI3 1866 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 H3BQ06 376 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 FSCN2O14926 492 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 STX6O43752 255 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 HIP1RO75146 1068 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 NPTXRO95502 500 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 EDN1P05305 212 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 ITGA4P13612 1032 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 LIG1P18858 919 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 PPM1AP35813 382 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 LTBRP36941 435 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 PPP2R5AQ15172 486 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 PTPAQ15257 358 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM187BQ17R55 369 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 CTC1Q2NKJ3 1217 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 HSCBQ8IWL3 235 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 CNNM3Q8NE01 707 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 URGCPQ8TCY9 931 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 LRRC15Q8TF66 581 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 RSPH1Q8WYR4 309 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 PRIMPOLQ96LW4 560 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 APOL6Q9BWW8 343 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 GBP3Q9H0R5 595 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 CLDND1Q9NY35 253 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 LZTS1Q9Y250 596 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa15.57■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 SFI1A8K8P3 1242 aa15.56■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 ACKR2O00590 384 aa15.56■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 LINC01565O15544 149 aa15.56■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 NCK2O43639 380 aa15.56■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 DDHD2O94830 711 aa15.56■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 POMCP01189 267 aa15.56■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 PRKCBP05771 671 aa15.56■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 GALTP07902 379 aa15.56■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 PLA2G4BP0C869 781 aa15.56■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms