RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.1■■□□□ 1.13
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SMIM20-201ENST00000506197 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.1■■□□□ 1.13
SMIM20-201ENST00000506197 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.1■■□□□ 1.13
SMIM20-201ENST00000506197 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SMIM20-201ENST00000506197 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.1■■□□□ 1.13
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SMIM20-201ENST00000506197 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
SMIM20-201ENST00000506197 STX1AQ16623 288 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM20-201ENST00000506197 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM20-201ENST00000506197 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SMIM20-201ENST00000506197 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM20-201ENST00000506197 USP38Q8NB14 1042 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM20-201ENST00000506197 KCNN1Q92952 543 aa22.04■■□□□ 1.12
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SMIM20-201ENST00000506197 TMEM206Q9H813 350 aa22.04■■□□□ 1.12
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