RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 CST5P28325 142 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 RARRES1P49788 294 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ASIC1P78348 528 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 NKX3-2P78367 333 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 UGCGQ16739 394 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 LONRF3Q496Y0 759 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 NAALADL2Q58DX5 795 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 GPBP1Q86WP2 473 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 MCPH1Q8NEM0 835 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 SH3TC2Q8TF17 1288 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 SLC7A3Q8WY07 619 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 SMARCE1Q969G3 411 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PANK2Q9BZ23 570 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 KBTBD4Q9NVX7 518 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 CENPFP49454 3210 aa10.77□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 KBTBD13C9JR72 458 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 E9PMD0 336 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 H3BRB1 525 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 HBP1O60381 514 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 CABYRO75952 493 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 MYL3P08590 195 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 CAPN2P17655 700 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 MARK3P27448 753 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 AFMP43652 599 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 SLC12A3P55017 1021 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 MTMR3Q13615 1198 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ECM1Q16610 540 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 XKR9Q5GH70 373 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 WDR44Q5JSH3 913 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 COX20Q5RI15 118 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 TRIML1Q8N9V2 468 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ARRDC4Q8NCT1 418 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PIGOQ8TEQ8 1089 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PAGE5Q96GU1 130 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 CEP170P1Q96L14 293 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 DRC1Q96MC2 740 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 CYP26B1Q9NR63 512 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 EXOC1Q9NV70 894 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM63CQ9P1W3 806 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ODF2LQ9ULJ1 636 aa10.76□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF862O60290 1169 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 USO1O60763 962 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ADAMTS4O75173 837 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PGK1P00558 417 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 GUCY2CP25092 1073 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 POU4F2Q12837 409 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PPFIA1Q13136 1202 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 CAMK4Q16566 473 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 MTERF2Q49AM1 385 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF484Q5JVG2 852 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 CNNM4Q6P4Q7 775 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 SASS6Q6UVJ0 657 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 KCNK18Q7Z418 384 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC65Q8IXS2 484 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ARMC5Q96C12 935 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 GSDMAQ96QA5 445 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 TRIM9Q9C026 710 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PHACTR1Q9C0D0 580 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 BCAS3Q9H6U6 928 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 DACH1Q9UI36 760 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 LRFN2Q9ULH4 789 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa10.75□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 DNM1LO00429 736 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 TNFRSF10BO14763 440 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 FAM13AO94988 1023 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC192P0DO97 292 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 GNAT1P11488 350 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 CCL5P13501 91 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 GAP43P17677 238 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 CYP11B2P19099 503 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 SCP2P22307 547 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 ABCD1P33897 745 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PPP1R2P41236 205 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PHKA2P46019 1235 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PURAQ00577 322 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PNOCQ13519 176 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 EMC2Q15006 297 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 PLCB4Q15147 1175 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 STX1AQ16623 288 aa10.74□□□□□ -0.69
CTPS1-211ENST00000497210 KIAA0753Q2KHM9 967 aa10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms