RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492283.1

RBMS1-215, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 5

Gene RBMS1, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-215	ENST00000492283	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	GPR32	O75388	356 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	NRIP1	P48552	1158 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	GPC3	P51654	580 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	PTGDR	Q13258	359 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	P2RX5	Q93086	422 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	NACC1	Q96RE7	527 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	ADAM2	Q99965	735 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBMS1-215	ENST00000492283	ACACB	O00763	2458 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283		A0A087WZ62	844 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	LAD1	O00515	517 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	ZBTB39	O15060	712 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	ASAP2	O43150	1006 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	PDIA5	Q14554	519 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	ZBTB33	Q86T24	672 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	TMEM143	Q96AN5	459 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	NLRP4	Q96MN2	994 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	PHF12	Q96QT6	1004 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	MTR	Q99707	1265 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283		A0A087WWV3	80 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	DGAT1	O75907	488 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	LYPLA2	O95372	231 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	ITGB1	P05556	798 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	DRP2	Q13474	957 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	CUL4A	Q13619	759 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	EMC2	Q15006	297 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	KRT79	Q5XKE5	535 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF410	Q86VK4	478 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	FAM228A	Q86W67	206 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	HSCB	Q8IWL3	235 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	CEP89	Q96ST8	783 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	TMX1	Q9H3N1	280 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	RGS18	Q9NS28	235 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	DACT1	Q9NYF0	836 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	TTC3	P53804	2025 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	RPA1	P27694	616 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	MTMR3	Q13615	1198 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	TFDP1	Q14186	410 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	BRAP	Q7Z569	592 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	KSR1	Q8IVT5	923 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBMS1-215	ENST00000492283	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		12.8	□□□□□ -0.36

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