RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489621.1

PDCL3P4-201, Transcript of phosducin-like 3 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene PDCL3P4, Length 720 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3P4-201ENST00000489621 NPHP1O15259 732 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 STX10O60499 249 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 DTNBO60941 627 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 UQCRHP07919 91 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 SKILP12757 684 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 RXRAP19793 462 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 KIR3DL1P43629 444 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 AFMP43652 599 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 PLCD1P51178 756 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 UBASH3AP57075 661 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 NLRP5P59047 1200 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 TFAP4Q01664 338 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 FZD5Q13467 585 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 KCNMB1Q16558 191 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 TTC38Q5R3I4 469 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 SPATA1Q5VX52 437 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 STYK1Q6J9G0 422 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 BLIDQ8IZY5 108 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 GPC2Q8N158 579 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 SPC24Q8NBT2 197 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 IQCDQ96DY2 449 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 CCDC51Q96ER9 411 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 CCDC17Q96LX7 622 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 MYL10Q9BUA6 226 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 BARHL2Q9NY43 387 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 KCNJ14Q9UNX9 436 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 FOCADQ5VW36 1801 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL3P4-201ENST00000489621 LTBP1Q14766 1721 aa6.59□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 FZD9O00144 591 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 ARHGAP6O43182 974 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 ZSCAN12O43309 604 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 BPNT1O95861 308 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 TSPY3P0CV98 308 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 TSPY8P0CW00 308 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 NPR1P16066 1061 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 ETV3P41162 512 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 CCZ1BP86790 482 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 NOGQ13253 232 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 TUBB2AQ13885 445 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 KCNB1Q14721 858 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 PTPN14Q15678 1187 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 ASPRV1Q53RT3 343 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 CST9Q5W186 159 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 KSR1Q8IVT5 923 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 VSTM4Q8IW00 320 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 KIF18AQ8NI77 898 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 FAM161BQ96MY7 647 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 CLIC6Q96NY7 704 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 CSRNP2Q9H175 543 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 IFNKQ9P0W0 207 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 NAV1Q8NEY1 1877 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL3P4-201ENST00000489621 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms