RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487558.1

CUL3-211, Transcript of cullin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CUL3, Length 1,093 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3-211ENST00000487558 SVIPQ8NHG7 77 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 MVB12AQ96EY5 273 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 CLIC6Q96NY7 704 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 ADI1Q9BV57 179 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 USP25Q9UHP3 1055 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 SERPINB13Q9UIV8 391 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 DNM3Q9UQ16 869 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 CYP7B1O75881 506 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 CELA3BP08861 270 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 WASP42768 502 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 NCKAP1LP55160 1127 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 IL13RA1P78552 427 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 CD83Q01151 205 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 CAP1Q01518 475 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 PGS1Q32NB8 556 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 KANK2Q63ZY3 851 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 GAREM2Q75VX8 874 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 GLB1L2Q8IW92 636 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 NRG4Q8WWG1 115 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 TEPSINQ96N21 525 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 GREM2Q9H772 168 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.32□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 ANO9A1A5B4 782 aa7.31□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 IL18BPO95998 194 aa7.31□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 MAN2A1Q16706 1144 aa7.31□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.31□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 GRAMD4Q6IC98 578 aa7.31□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.31□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.31□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.31□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 CERS3Q8IU89 383 aa7.31□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 FAM43AQ8N2R8 423 aa7.31□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 STPG3Q8N7X2 389 aa7.31□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.31□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 HDAC10Q969S8 669 aa7.31□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 CHST12Q9NRB3 414 aa7.31□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 FBXO10Q9UK96 956 aa7.31□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 INTUQ9ULD6 942 aa7.31□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 CCDC154A6NI56 674 aa7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 H3BML4 177 aa7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 FFAR3O14843 346 aa7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 CHGBP05060 677 aa7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 ATF2P15336 505 aa7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 MC3RP41968 323 aa7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 MCAMP43121 646 aa7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 ITGA1P56199 1179 aa7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 DENND1CQ8IV53 801 aa7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 TTLL6Q8N841 843 aa7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 DYDC2Q96IM9 177 aa7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 KCND1Q9NSA2 647 aa7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 PTPN22Q9Y2R2 807 aa7.3□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 PHF19Q5T6S3 580 aa7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 PPP4R3AQ6IN85 833 aa7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 MIGA2Q7L4E1 593 aa7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 GGNQ86UU5 652 aa7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 KYQ8NBH2 561 aa7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 OSBPL6Q9BZF3 934 aa7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 HAPLN2Q9GZV7 340 aa7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 SCOCQ9UIL1 159 aa7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 IPPQ9Y573 584 aa7.29□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 TUSC2O75896 110 aa7.28□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 FSBPO95073 299 aa7.28□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 ZBED1O96006 694 aa7.28□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 HRGP04196 525 aa7.28□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 EDNRBP24530 442 aa7.28□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 USP14P54578 494 aa7.28□□□□□ -1.24
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