RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 ZP2Q05996 745 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 ERMNQ8TAM6 284 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 TMX3Q96JJ7 454 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 NACC1Q96RE7 527 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 GBP3Q9H0R5 595 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 ARID2Q68CP9 1835 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 B4GALT3O60512 393 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 EYA4O95677 639 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 POU5F1BQ06416 359 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 RSAD1Q9HA92 442 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 GALTP07902 379 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 AXLP30530 894 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 COASYQ13057 564 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 ECM1Q16610 540 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 AMHR2Q16671 573 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 NOTUMQ6P988 496 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 URGCPQ8TCY9 931 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 TMEM169Q96HH4 297 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 RNF39Q9H2S5 420 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 IPPQ9Y573 584 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 B4GALT5O43286 388 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 DDHD2O94830 711 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 POMCP01189 267 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 CA8P35219 290 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 SLC11A1P49279 550 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 PTGDRQ13258 359 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 MCTP1Q6DN14 999 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 PADI6Q6TGC4 694 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 IGSF21Q96ID5 467 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 CSRNP2Q9H175 543 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 HES2Q9Y543 173 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.83■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.83■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.83■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 ITGA4P13612 1032 aa20.83■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 COL9A1P20849 921 aa20.83■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 KCNC3Q14003 757 aa20.83■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.83■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 VPS52Q8N1B4 723 aa20.83■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 CNNM3Q8NE01 707 aa20.83■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.83■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 KIF3AQ9Y496 699 aa20.83■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 CXCL14O95715 111 aa20.82■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 GJB2P29033 226 aa20.82■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.82■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.82■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 BSNDQ8WZ55 320 aa20.82■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 CCDC51Q96ER9 411 aa20.82■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.82■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 APOL6Q9BWW8 343 aa20.82■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 POLD4Q9HCU8 107 aa20.82■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.82■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa20.82■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 FSD2A1L4K1 749 aa20.81■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.81■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 CYP11B2P19099 503 aa20.81■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 PDIA5Q14554 519 aa20.81■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 IL17AQ16552 155 aa20.81■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.81■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 GAD1Q99259 594 aa20.81■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 APOL5Q9BWW9 433 aa20.81■□□□□ 0.92
UPP1-211ENST00000482015 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms