RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 RDM1Q8NG50 284 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 MYLIPQ8WY64 445 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 RABGGTAQ92696 567 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 WDR24Q96S15 920 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 GPR20Q99678 358 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 TCHHQ07283 1943 aa6.53□□□□□ -1.36
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SHQ1-205ENST00000468371 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-205ENST00000468371 CNGA4Q8IV77 575 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-205ENST00000468371 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-205ENST00000468371 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-205ENST00000468371 NEK9Q8TD19 979 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-205ENST00000468371 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-205ENST00000468371 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-205ENST00000468371 TAF4BQ92750 862 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-205ENST00000468371 K7ERI5 159 aa6.51□□□□□ -1.37
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SHQ1-205ENST00000468371 STX10O60499 249 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1-205ENST00000468371 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
SHQ1-205ENST00000468371 CAND2O75155 1236 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1-205ENST00000468371 F2P00734 622 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1-205ENST00000468371 ITGA4P13612 1032 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1-205ENST00000468371 CASP1P29466 404 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1-205ENST00000468371 HPDP32754 393 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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