RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 SLC39A14Q15043 492 aa22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 SPECC1Q5M775 1068 aa22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 DAW1Q8N136 415 aa22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 CNNM3Q8NE01 707 aa22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 DRC1Q96MC2 740 aa22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 TIPINQ9BVW5 301 aa22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 FZD8Q9H461 694 aa22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 F13A1P00488 732 aa22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 ITGB1P05556 798 aa22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 PRKCBP05771 671 aa22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 LIG1P18858 919 aa22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 PLCG1P19174 1290 aa22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 MAPK7Q13164 816 aa22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 MAPK6Q16659 721 aa22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 FAM187BQ17R55 369 aa22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 CLIC6Q96NY7 704 aa22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 KCND2Q9NZV8 630 aa22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 IPPQ9Y573 584 aa22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.9■■□□□ 1.26
VARS-218ENST00000459667 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 EFNA5P52803 228 aa22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 PEX3P56589 373 aa22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 PKP1Q13835 747 aa22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 STK38Q15208 465 aa22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 USP49Q70CQ1 688 aa22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 LRRC15Q8TF66 581 aa22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 EPSTI1Q96J88 318 aa22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 RSAD1Q9HA92 442 aa22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.89■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 A0A1B0GUA9 196 aa22.88■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 CCDC169A6NNP5 214 aa22.88■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 OFD1O75665 1012 aa22.88■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 CSPG5O95196 566 aa22.88■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 ITGA4P13612 1032 aa22.88■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 NPTX2P47972 431 aa22.88■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.88■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.88■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.88■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 ZNF558Q96NG5 402 aa22.88■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.88■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.88■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 THEGQ9P2T0 379 aa22.88■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 MYH11P35749 1972 aa22.87■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 ACKR2O00590 384 aa22.87■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 NPTXRO95502 500 aa22.87■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 TXLNAP40222 546 aa22.87■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.87■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 GPBP1Q86WP2 473 aa22.87■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 URGCPQ8TCY9 931 aa22.87■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 POF1BQ8WVV4 589 aa22.87■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 RAD54LQ92698 747 aa22.87■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.87■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.87■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 HES2Q9Y543 173 aa22.87■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 SFI1A8K8P3 1242 aa22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 N4BP3O15049 544 aa22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 FGF18O76093 207 aa22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 EDN1P05305 212 aa22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 DNAJB1P25685 340 aa22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 PBX3P40426 434 aa22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 MCM6Q14566 821 aa22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
VARS-218ENST00000459667 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms