RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDKL5O76039 1030 aa9.45□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEC24BO95487 1268 aa9.45□□□□□ -0.9
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GAPDHP28-201ENST00000455134 CTSAP10619 480 aa9.45□□□□□ -0.9
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GAPDHP28-201ENST00000455134 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.43□□□□□ -0.9
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GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA1841Q6NSI8 718 aa9.43□□□□□ -0.9
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GAPDHP28-201ENST00000455134 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLFN12Q8IYM2 578 aa9.43□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 GSTCDQ8NEC7 633 aa9.43□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.43□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 RSPH1Q8WYR4 309 aa9.43□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 CPB2Q96IY4 423 aa9.43□□□□□ -0.9
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