RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 C5orf42Q9H799 3197 aa21.75■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 OR52Z1P0C646 297 aa21.75■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 PTENP60484 403 aa21.75■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 TTC38Q5R3I4 469 aa21.75■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.75■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.75■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 CPB2Q96IY4 423 aa21.75■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 APOL5Q9BWW9 433 aa21.75■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.75■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 CARNS1A5YM72 827 aa21.74■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 C19orf67A6NJJ6 358 aa21.74■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 DCXO43602 365 aa21.74■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 TSPAN1O60635 241 aa21.74■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 GPR37L1O60883 481 aa21.74■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 CXCL14O95715 111 aa21.74■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 CAPSQ13938 189 aa21.74■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 NOTUMQ6P988 496 aa21.74■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.74■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 VPS52Q8N1B4 723 aa21.74■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.74■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.74■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 MED24O75448 989 aa21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 POMCP01189 267 aa21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 GALTP07902 379 aa21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 ITGA4P13612 1032 aa21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 AXLP30530 894 aa21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 ARL2P36404 184 aa21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 UBXN11Q5T124 520 aa21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 CNNM3Q8NE01 707 aa21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 IGSF21Q96ID5 467 aa21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 NACC1Q96RE7 527 aa21.73■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 ARID2Q68CP9 1835 aa21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 ST18O60284 1047 aa21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 GLRA2P23416 452 aa21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 SLC11A1P49279 550 aa21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 ANKRD54Q6NXT1 300 aa21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 POTEGQ6S5H5 508 aa21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 APOL6Q9BWW8 343 aa21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 UBN1Q9NPG3 1134 aa21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 C11orf16Q9NQ32 467 aa21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 IPPQ9Y573 584 aa21.72■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 POU5F1BQ06416 359 aa21.71■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 NBR1Q14596 966 aa21.71■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 RABEP1Q15276 862 aa21.71■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.71■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 CASP10Q92851 521 aa21.71■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa21.71■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 CSRNP2Q9H175 543 aa21.71■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa21.71■■□□□ 1.07
NPAS1-201ENST00000439365 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.7■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 DDHD2O94830 711 aa21.7■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 ALDH2P05091 517 aa21.7■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 TRAPPC10P48553 1259 aa21.7■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.7■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 HAUS3Q68CZ6 603 aa21.7■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa21.7■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 RNF135Q8IUD6 432 aa21.7■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 HACE1Q8IYU2 909 aa21.7■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC51Q96ER9 411 aa21.7■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 ZBP1Q9H171 429 aa21.7■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 MUTYHQ9UIF7 546 aa21.7■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.7■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 KIF3AQ9Y496 699 aa21.7■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 HES2Q9Y543 173 aa21.7■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 B4GALT5O43286 388 aa21.69■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 RPA1P27694 616 aa21.69■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 MCTP1Q6DN14 999 aa21.69■■□□□ 1.06
NPAS1-201ENST00000439365 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms