RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 RSAD1Q9HA92 442 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 FAN1Q9Y2M0 1017 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 NRP1O14786 923 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 TDP2O95551 362 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 ID4P47928 161 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 PSMC5P62195 406 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 CYP26C1Q6V0L0 522 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 ETNPPLQ8TBG4 499 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 WNT16Q9UBV4 365 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 CACNA1AO00555 2505 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 NARSO43776 548 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 SOD2P04179 222 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 UBXN11Q5T124 520 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 MOXD1Q6UVY6 613 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 RPS6KC1Q96S38 1066 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 MAN1C1Q9NR34 630 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 DPP7Q9UHL4 492 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 PCDHA4Q9UN74 947 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTBP11-201ENST00000436287 VPS13AQ96RL7 3174 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 M0R2N6 131 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 TEX28O15482 410 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 POMCP01189 267 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 URODP06132 367 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 RPS6KB1P23443 525 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 AK2P54819 239 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 NPEPPSP55786 919 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 EVCP57679 992 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 CCT2P78371 535 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 PLA2G4FQ68DD2 849 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 TAS1R1Q7RTX1 841 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 EXOC8Q8IYI6 725 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 RSAD2Q8WXG1 361 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC7A3Q8WY07 619 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 STAMQ92783 540 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 SEMA4AQ9H3S1 761 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 MINDY3Q9H8M7 445 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 EPS15L1Q9UBC2 864 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 SNX14Q9Y5W7 946 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF292O60281 2723 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 KRBA1A5PL33 1030 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 EML1O00423 815 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 C2CD2LO14523 706 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 CDC45O75419 566 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 EFEMP2O95967 443 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 ADH1AP07327 375 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 CFHP08603 1231 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 NCLP19338 710 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 HSPA4P34932 840 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 QARSP47897 775 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 KIAA0319Q5VV43 1072 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 SKAP1Q86WV1 359 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 COLGALT2Q8IYK4 626 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC44A3Q8N4M1 653 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 CNNM3Q8NE01 707 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 NXPE3Q969Y0 559 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 RXFP1Q9HBX9 757 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 UBN1Q9NPG3 1134 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 MARCH5Q9NX47 278 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 PPME1Q9Y570 386 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 INPPL1O15357 1258 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 PAPLNO95428 1278 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 GLUD1P00367 558 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 PPP2R5CQ13362 524 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 BLIDQ8IZY5 108 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 DAGLBQ8NCG7 672 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 HDAC7Q8WUI4 952 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM143Q96AN5 459 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 CEP170P1Q96L14 293 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 MYADMQ96S97 322 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
ACTBP11-201ENST00000436287 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms