RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa23.21■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa23.21■■□□□ 1.31
UBXN4-204ENST00000426921 B4GALT3O60512 393 aa23.2■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 AXLP30530 894 aa23.2■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 RARRES1P49788 294 aa23.2■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 LLGL2Q6P1M3 1020 aa23.2■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 VPS52Q8N1B4 723 aa23.2■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC51Q96ER9 411 aa23.2■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.2■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.2■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 INPPL1O15357 1258 aa23.19■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 TSPAN1O60635 241 aa23.19■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 CTSAP10619 480 aa23.19■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 ARL2P36404 184 aa23.19■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 TXKP42681 527 aa23.19■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 SLC11A1P49279 550 aa23.19■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 FOSBP53539 338 aa23.19■■□□□ 1.3
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UBXN4-204ENST00000426921 GIT2Q14161 759 aa23.19■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 CNNM3Q8NE01 707 aa23.19■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 URGCPQ8TCY9 931 aa23.19■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 EDAQ92838 391 aa23.19■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.19■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.19■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 STK39Q9UEW8 545 aa23.19■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 POTEMA6NI47 508 aa23.18■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 ERLIN2O94905 339 aa23.18■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 CAPSQ13938 189 aa23.18■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 TFDP1Q14186 410 aa23.18■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 AMHR2Q16671 573 aa23.18■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF280BQ86YH2 543 aa23.18■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.18■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 VN1R3Q9BXE9 311 aa23.18■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.18■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 TECTAO75443 2155 aa23.18■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 CXCL14O95715 111 aa23.17■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.17■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.17■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.17■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 NOTUMQ6P988 496 aa23.17■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.17■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 UBN1Q9NPG3 1134 aa23.17■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 MUC6Q6W4X9 2439 aa23.17■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 DDHD2O94830 711 aa23.16■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 GLRA2P23416 452 aa23.16■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 ITIH3Q06033 890 aa23.16■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 HFE2Q6ZVN8 426 aa23.16■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.16■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 C8orf76Q96K31 380 aa23.16■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa23.16■■□□□ 1.3
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UBXN4-204ENST00000426921 ADAM7Q9H2U9 754 aa23.16■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.16■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 IPPQ9Y573 584 aa23.16■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.15■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 MCM7P33993 719 aa23.15■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 GUCY1B3Q02153 619 aa23.15■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 PTPN14Q15678 1187 aa23.15■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.15■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 NECTIN4Q96NY8 510 aa23.15■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 CSRNP2Q9H175 543 aa23.15■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 DZANK1Q9NVP4 752 aa23.15■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF318Q5VUA4 2279 aa23.15■■□□□ 1.3
UBXN4-204ENST00000426921 ITGA4P13612 1032 aa23.14■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 ZXDAP98168 799 aa23.14■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa23.14■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.14■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.14■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.14■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 AUTS2Q8WXX7 1259 aa23.14■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 KIF2CQ99661 725 aa23.14■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 APOL5Q9BWW9 433 aa23.14■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 KCNH6Q9H252 994 aa23.14■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa23.14■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 DSC1Q08554 894 aa23.13■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 CES5AQ6NT32 575 aa23.13■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 TRIM67Q6ZTA4 783 aa23.13■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 MCPH1Q8NEM0 835 aa23.13■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 CPB2Q96IY4 423 aa23.13■■□□□ 1.29
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