RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 COG1Q8WTW3 980 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX19Q92543 992 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEB5Q9BZ81 275 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM187AA6NFU0 413 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA8MH3BSY2 632 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SDC4P31431 198 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 DRP2Q13474 957 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 NFRKBQ6P4R8 1299 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM270Q6UE05 265 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RGS9BPQ6ZS82 235 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 NLRP14Q86W24 1093 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.541e-6■■□□□ 13.1
EFTUD2-202ENST00000426333 ADA2Q9NZK5 511 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 LCMT1Q9UIC8 334 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SCN11AQ9UI33 1791 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX2O60749 519 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CIITAP33076 1130 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PCYT1AP49585 367 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 MECOMQ03112 1051 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 GRAMD1AQ96CP6 724 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 BRIP1Q9BX63 1249 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 FSD1LQ9BXM9 530 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC24A3Q9HC58 644 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ANP32DO95626 131 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT7P08729 469 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.545e-7■■□□□ 12
EFTUD2-202ENST00000426333 POU5F1BQ06416 359 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 FLOT2Q14254 428 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 NAALADL2Q58DX5 795 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 BRINP3Q76B58 766 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP11CQ8NB49 1132 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ASNSP08243 561 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 OSBPP22059 807 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM179Q6ZVK1 233 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 FRA10AC1Q70Z53 315 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 BPIFA3Q9BQP9 254 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP69A5D8W1 941 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 KITP10721 976 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT4P19013 534 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 BCAR1P56945 870 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR162Q16538 588 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PASD1Q8IV76 773 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC8Q8TAM2 541 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM20AQ96MK3 541 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP4F11Q9HBI6 524 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 STK36Q9NRP7 1315 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ERVV-1B6SEH8 477 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC22O60826 627 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RAD23BP54727 409 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 GPS1Q13098 491 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 27.2
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC10A5Q5PT55 438 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PADI6Q6TGC4 694 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM196AQ6ZSG2 479 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 LZICQ8WZA0 190 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R16BQ96T49 567 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PCSK1NQ9UHG2 260 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 FTLP02792 175 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 JAK3P52333 1124 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC144BQ3MJ40 725 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SZRD1Q7Z422 152 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP18Q8N392 663 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC26A7Q8TE54 656 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 STAP1Q9ULZ2 295 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE4BO95155 1302 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TYK2P29597 1187 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC14Q15048 493 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF6Q15052 776 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TBCCQ15814 346 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms