RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424263.6

PRDM11-201, Transcript of PR/SET domain 11, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene PRDM11, Length 1,858 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM11-201ENST00000424263 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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PRDM11-201ENST00000424263 CXCL10P02778 98 aa21.92■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 FGFR4P22455 802 aa21.92■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 RFC2P35250 354 aa21.92■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 ALCAMQ13740 583 aa21.92■■□□□ 1.1
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PRDM11-201ENST00000424263 HVCN1Q96D96 273 aa21.92■■□□□ 1.1
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PRDM11-201ENST00000424263 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
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PRDM11-201ENST00000424263 CD52P31358 61 aa21.91■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 ABCD1P33897 745 aa21.91■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 MORC3Q14149 939 aa21.91■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.91■■□□□ 1.1
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PRDM11-201ENST00000424263 UBE4BO95155 1302 aa21.91■■□□□ 1.1
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PRDM11-201ENST00000424263 BMP6P22004 513 aa21.9■■□□□ 1.1
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PRDM11-201ENST00000424263 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
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PRDM11-201ENST00000424263 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.9■■□□□ 1.1
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PRDM11-201ENST00000424263 PADI3Q9ULW8 664 aa21.9■■□□□ 1.1
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PRDM11-201ENST00000424263 ACKR2O00590 384 aa21.9■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 TSPAN1O60635 241 aa21.9■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 CSF2RAP15509 400 aa21.9■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 BMT2Q1RMZ1 405 aa21.9■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.9■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.9■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 TMEM199Q8N511 208 aa21.9■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.9■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.9■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa21.9■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.89■■□□□ 1.1
PRDM11-201ENST00000424263 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.89■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 B4GALT5O43286 388 aa21.89■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 CAPN15O75808 1086 aa21.89■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 ERLIN2O94905 339 aa21.89■■□□□ 1.09
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PRDM11-201ENST00000424263 KCNA1Q09470 495 aa21.89■■□□□ 1.09
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PRDM11-201ENST00000424263 PTPRSQ13332 1948 aa21.88■■□□□ 1.09
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PRDM11-201ENST00000424263 ISM2Q6H9L7 571 aa21.88■■□□□ 1.09
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PRDM11-201ENST00000424263 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.88■■□□□ 1.09
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PRDM11-201ENST00000424263 ANO10Q9NW15 660 aa21.88■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 USP20Q9Y2K6 914 aa21.88■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 CITO14578 2027 aa21.87■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 TTC3P53804 2025 aa21.87■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 PIGRP01833 764 aa21.87■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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PRDM11-201ENST00000424263 FPGSQ05932 587 aa21.86■■□□□ 1.09
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PRDM11-201ENST00000424263 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.86■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 IKZF4Q9H2S9 585 aa21.86■■□□□ 1.09
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PRDM11-201ENST00000424263 PFKMP08237 780 aa21.86■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 AXLP30530 894 aa21.86■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.099e-6■■□□□ 12.8
PRDM11-201ENST00000424263 ZPBP2Q6X784 338 aa21.86■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 SEPT8Q92599 483 aa21.86■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 APBB2Q92870 758 aa21.86■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 CPB2Q96IY4 423 aa21.86■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.86■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 IL23AQ9NPF7 189 aa21.86■■□□□ 1.09
PRDM11-201ENST00000424263 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.86■■□□□ 1.09
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