RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 FIZ1Q96SL8 496 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 DNAJC18Q9H819 358 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 MYH11P35749 1972 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 SNX3O60493 162 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 MESDQ14696 234 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 LLGL1Q15334 1064 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 PYGMP11217 842 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 ALAS1P13196 640 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 GAP43P17677 238 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 COMTP21964 271 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 SREBF1P36956 1147 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 PEX5P50542 639 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 NFIAQ12857 509 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 SLFN13Q68D06 897 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 TPH2Q8IWU9 490 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM212AQ96EL1 285 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 RIMBP2O15034 1052 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 LONRF1Q17RB8 773 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 LMO3Q8TAP4 145 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 TMEM109Q9BVC6 243 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.24■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 PODXLO00592 558 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 CHMP2AO43633 222 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 RARAP10276 462 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 NCALDP61601 193 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 MYO1EQ12965 1108 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 BANK1Q8NDB2 785 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 HOOK2Q96ED9 719 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 BTBD6Q96KE9 485 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 MLXIPLQ9NP71 852 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 RARGP13631 454 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 PARVGQ9HBI0 331 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 DMAC2Q9NW81 257 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 PFASO15067 1338 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 SLITRK3O94933 977 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 DLG4P78352 724 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 AGAP11Q8TF27 550 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 ART4Q93070 314 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 DYDC2Q96IM9 177 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 NFIL3Q16649 462 aa20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 AMNQ9BXJ7 453 aa20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 ACSL3O95573 720 aa20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 RIPK1Q13546 671 aa20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 CLUL1Q15846 466 aa20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC15A2Q16348 729 aa20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 EBF2Q9HAK2 575 aa20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 PARP2Q9UGN5 583 aa20.22■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 NQO1P15559 274 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 HSPA6P17066 643 aa20.21■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF76P36508 570 aa20.21■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 PDE6CP51160 858 aa20.21■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 BFSP1Q12934 665 aa20.21■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 SLMAPQ14BN4 828 aa20.21■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.21■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms