RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393408.7

CBX1-202, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-202ENST00000393408 CEP89Q96ST8 783 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 RASAL2Q9UJF2 1139 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 TMX2Q9Y320 296 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 SNX24Q9Y343 169 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 K7ENM7 598 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 HSPA6P17066 643 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 USP8P40818 1118 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 MARCKSL1P49006 195 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 PLTPP55058 493 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 EPC2Q52LR7 807 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 TATDN2Q93075 761 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 C18orf8Q96DM3 657 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 CABS1Q96KC9 395 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 BCS1LQ9Y276 419 aa20.34■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 VAMP7P51809 220 aa20.33■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.33■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 PRELID2Q8N945 189 aa20.33■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 FBXO25Q8TCJ0 367 aa20.33■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 NEK9Q8TD19 979 aa20.33■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.33■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.852e-7■□□□□ 10
CBX1-202ENST00000393408 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.33■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 GRHL1Q9NZI5 618 aa20.33■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CBX1-202ENST00000393408 TISP43B9A030 160 aa20.33■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 P4HA2O15460 535 aa20.33■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 CTNNA2P26232 953 aa20.33■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 CHRNA3P32297 505 aa20.33■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 GPC5P78333 572 aa20.33■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 PADI6Q6TGC4 694 aa20.33■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 CCDC121Q6ZUS5 278 aa20.33■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.33■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 CENPTQ96BT3 561 aa20.33■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.33■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.33■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 BACH1O14867 736 aa20.32■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 CETN1Q12798 172 aa20.32■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.32■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.32■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 RIT2Q99578 217 aa20.32■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 GOPCQ9HD26 462 aa20.32■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 PNMA2Q9UL42 364 aa20.32■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 PEX5P50542 639 aa20.32■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 DENND2CQ68D51 928 aa20.32■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.32■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.32■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 MDM1Q8TC05 714 aa20.32■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 PGM2Q96G03 612 aa20.32■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 TMEM206Q9H813 350 aa20.32■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 RTN2O75298 545 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 MTA2O94776 668 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 DRD4P21917 467 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 GCLMP48507 274 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 CDR1P51861 262 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 ALCAMQ13740 583 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 ERMARDQ5T6L9 678 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 TTC27Q6P3X3 843 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 AFF2P51816 1311 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 RPTORQ8N122 1335 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 GGPS1O95749 300 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 COMTP21964 271 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 RPL21P46778 160 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 SMTNP53814 917 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 FAM129AQ9BZQ8 928 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 MMP10P09238 476 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 ALAS1P13196 640 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 CHRNB2P17787 502 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 GBP1P32455 592 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 KAT5Q92993 513 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 CD101Q93033 1021 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-202ENST00000393408 ACCSQ96QU6 501 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms