RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 TDGF1P13385 188 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 LAMP2P13473 410 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDC27P30260 824 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC26A2P50443 739 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 AK2P54819 239 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 DMWDQ09019 674 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRDNQ13061 729 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRAF1Q13077 416 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
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RNU6-171P-201ENST00000384354 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
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RNU6-171P-201ENST00000384354 WDR44Q5JSH3 913 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 TTC22Q5TAA0 569 aa6.12□□□□□ -1.43
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RNU6-171P-201ENST00000384354 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 PALB2Q86YC2 1186 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
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RNU6-171P-201ENST00000384354 ZFP42Q96MM3 310 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAP3K14Q99558 947 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 KXD1Q9BQD3 176 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
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RNU6-171P-201ENST00000384354 RNF39Q9H2S5 420 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 NCDNQ9UBB6 729 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
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RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC27A2O14975 620 aa6.11□□□□□ -1.43
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RNU6-171P-201ENST00000384354 ADCY7P51828 1080 aa6.11□□□□□ -1.43
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RNU6-171P-201ENST00000384354 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
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RNU6-171P-201ENST00000384354 PPM1JQ5JR12 505 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.11□□□□□ -1.43
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RNU6-171P-201ENST00000384354 SKAP1Q86WV1 359 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.11□□□□□ -1.43
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RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBTB44Q8NCP5 570 aa6.11□□□□□ -1.43
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RNU6-171P-201ENST00000384354 ITFG1Q8TB96 612 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 ING5Q8WYH8 240 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 NELL1Q92832 810 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAP4K1Q92918 833 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCLT1Q96NL6 688 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAP7D2Q96T17 732 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.11□□□□□ -1.43
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RNU6-171P-201ENST00000384354 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 EPC1Q9H2F5 836 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 LTB4R2Q9NPC1 389 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP18Q9UMW8 372 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.11□□□□□ -1.43
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