RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 SLFN13Q68D06 897 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 BTNL9Q6UXG8 535 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD53Q8N9V6 530 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 SSH1Q8WYL5 1049 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 RABGGTAQ92696 567 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 LMF1Q96S06 567 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 ING3Q9NXR8 418 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 RTEL1Q9NZ71 1219 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 SCOCQ9UIL1 159 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 JAG2Q9Y219 1238 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 MRFAP1Q9Y605 127 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF536O15090 1300 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 PMS2P1A4D2B8 440 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 ALDH1A2O94788 518 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 TOX4O94842 621 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 CR2P20023 1033 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 ODF1Q14990 250 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 ABHD15Q6UXT9 468 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 TAX1BP1Q86VP1 789 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 CHMP4CQ96CF2 233 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC37BQ96QE4 947 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 GPHA2Q96T91 129 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 DPYSL5Q9BPU6 564 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 OAZ3Q9UMX2 235 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 MTSS1O43312 755 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC26A4O43511 780 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 CDC14BO60729 498 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 JUNP05412 331 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 C5AR1P21730 350 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 CTSSP25774 331 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 MCL1Q07820 350 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 MALLQ13021 153 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 DUSP8Q13202 625 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 GAGE13Q4V321 117 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 C19orf54Q5BKX5 351 aa5.18□□□□□ -1.58
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RABGGTB-202ENST00000370826 LIMS2Q7Z4I7 341 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB46Q86UZ6 589 aa5.18□□□□□ -1.58
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RABGGTB-202ENST00000370826 SNX33Q8WV41 574 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 RELTQ969Z4 430 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 TEKT5Q96M29 485 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 GNRHR2Q96P88 292 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 GREM2Q9H772 168 aa5.18□□□□□ -1.58
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RABGGTB-202ENST00000370826 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 RPTORQ8N122 1335 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 PRAMEF4O60810 478 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFS2O75306 463 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 MCAMP43121 646 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP3CAQ08209 521 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 RIN1Q13671 783 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 NFIXQ14938 502 aa5.17□□□□□ -1.58
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RABGGTB-202ENST00000370826 KRT40Q6A162 431 aa5.17□□□□□ -1.58
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RABGGTB-202ENST00000370826 HOOK2Q96ED9 719 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 MSL2Q9HCI7 577 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 DMRT3Q9NQL9 472 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR42O15529 346 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 AKR1B10O60218 316 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 S100BP04271 92 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 ITGB3P05106 788 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 EPHB1P54762 984 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 WNT3AP56704 352 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 ODR4Q5SWX8 454 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 TCTN3Q6NUS6 607 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 GLB1LQ6UWU2 654 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-202ENST00000370826 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
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