RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 KAT5Q92993 513 aa20.29■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.29■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 100.9
CITED2-201ENST00000367651 STK24Q9Y6E0 443 aa20.29■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.28■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.28■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.28■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.28■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 LRRC34Q8IZ02 419 aa20.28■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.28■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 SGSM3Q96HU1 749 aa20.28■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20.28■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 ACP6Q9NPH0 428 aa20.28■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.28■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 A0A1W2PRG0 241 aa20.28■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 COMTP21964 271 aa20.28■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.28■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 GMCL1Q96IK5 515 aa20.28■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.28■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 EXOC3O60645 756 aa20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 ADRA2BP18089 450 aa20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 CTNNA2P26232 953 aa20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 PEX5P50542 639 aa20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 CDR1P51861 262 aa20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 PPP3CAQ08209 521 aa20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 XRCC4Q13426 336 aa20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 PPP2R5AQ15172 486 aa20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 DAW1Q8N136 415 aa20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 BTBD6Q96KE9 485 aa20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 KDM4CQ9H3R0 1056 aa20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.27■□□□□ 0.84
CITED2-201ENST00000367651 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 TRIM37O94972 964 aa20.27■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 PYGMP11217 842 aa20.27■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 BMP3P12645 472 aa20.27■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 MESDQ14696 234 aa20.27■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 SNCBQ16143 134 aa20.27■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 PPP2R5EQ16537 467 aa20.27■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CCDC38Q502W7 563 aa20.27■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.27■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CCDC197Q8NCU1 140 aa20.27■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.27■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.27■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 EMSYQ7Z589 1322 aa20.27■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CCT8L1PA6NM43 557 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 PPIP5K2O43314 1243 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CFBP00751 764 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 PPP2R5CQ13362 524 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 SLC5A5Q92911 643 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 TRPC6Q9Y210 931 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CCDC169A6NNP5 214 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 ALAS1P13196 640 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CHRNA3P32297 505 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 KCNJ1P48048 391 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 IFNAR2P48551 515 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 LLGL1Q15334 1064 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 STRA6Q9BX79 667 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CXorf56Q9H5V9 222 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 RASAL2Q9UJF2 1139 aa20.26■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 UBE4BO95155 1302 aa20.25■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 PIK3CDO00329 1044 aa20.25■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 HIP1RO75146 1068 aa20.25■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 GH2P01242 217 aa20.25■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 CHRNB2P17787 502 aa20.25■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 PRELPP51888 382 aa20.25■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.25■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.25■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 SCLT1Q96NL6 688 aa20.25■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 RIPK2O43353 540 aa20.24■□□□□ 0.83
CITED2-201ENST00000367651 SGPL1O95470 568 aa20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms