RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366661.8

TTC13-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-201ENST00000366661 LRRC37AA6NMS7 1700 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 OATP04181 439 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 ATP6V1C1P21283 382 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 SEPT2Q15019 361 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 NAB2Q15742 525 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 ASIC2Q16515 512 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 EXOC3L4Q17RC7 722 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 STK32AQ8WU08 396 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 CEP95Q96GE4 821 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 TMEM47Q9BQJ4 181 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 ADAM7Q9H2U9 754 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 ETNK2Q9NVF9 386 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 PPP4CP60510 307 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 DR1Q01658 176 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 BNIP1Q12981 228 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 DNAJC3Q13217 504 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 SBK1Q52WX2 424 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 SCYL3Q8IZE3 742 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 RUBCNQ92622 972 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 DCTN4Q9UJW0 460 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 DOCK2Q92608 1830 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 CLRN2A0PK11 232 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 PEX11AO75192 247 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 TPBGLP0DKB5 382 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 CABP7Q86V35 215 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 TEX9Q8N6V9 391 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 TEKT1Q969V4 418 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 OPTNQ96CV9 577 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 MKNK1Q9BUB5 465 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 CUEDC2Q9H467 287 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 BCS1LQ9Y276 419 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 A0A1W2PRG0 241 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 KRT36O76013 467 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 FAM163BP0C2L3 166 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 FAM200BP0CF97 657 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 CRKP46108 304 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 GNAQP50148 359 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 CNGA2Q16280 664 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 TMTC3Q6ZXV5 915 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 PITPNM3Q9BZ71 974 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 CHD4Q14839 1912 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 KLRC4O43908 158 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 FLOT1O75955 427 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 AKR1B1P15121 316 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 DPEP1P16444 411 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 TXKP42681 527 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 EMC10Q5UCC4 262 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 STYK1Q6J9G0 422 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 SLF2Q8IX21 1173 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 BICD1Q96G01 975 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 PHF20Q9BVI0 1012 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 KCNMB3Q9NPA1 279 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 RNF14Q9UBS8 474 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 SNX30Q5VWJ9 437 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 PWWP2AQ96N64 755 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 ERGIC2Q96RQ1 377 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 CARD9Q9H257 536 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 GPCPD1Q9NPB8 672 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 OSGEPQ9NPF4 335 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 PAEPP09466 180 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 BRAFP15056 766 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 MYBPC3Q14896 1274 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 NCAPG2Q86XI2 1143 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 ECHDC2Q86YB7 292 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 BAP1Q92560 729 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 C18orf8Q96DM3 657 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 ERLEC1Q96DZ1 483 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 ERVK-5Q9HDB9 667 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 ARHGEF3Q9NR81 526 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 TXNDC9O14530 226 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 CAPN9O14815 690 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 CPA2P48052 419 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 MAN2A1Q16706 1144 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 ZNF365Q70YC5 407 aa16.47■□□□□ 0.23
TTC13-201ENST00000366661 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms