RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 DHX15O43143 795 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
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SH3BP1-201ENST00000357436 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 NCANO14594 1321 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP1R37O75864 691 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 KCTD16Q68DU8 428 aa20.32■□□□□ 0.84
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SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM49CP0CI26 452 aa20.32■□□□□ 0.84
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SH3BP1-201ENST00000357436 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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SH3BP1-201ENST00000357436 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 EFCC1Q9HA90 598 aa20.32■□□□□ 0.84
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SH3BP1-201ENST00000357436 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.32■□□□□ 0.84
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SH3BP1-201ENST00000357436 SLC35G2Q8TBE7 412 aa20.31■□□□□ 0.84
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SH3BP1-201ENST00000357436 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.31■□□□□ 0.84
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SH3BP1-201ENST00000357436 BFSP1Q12934 665 aa20.3■□□□□ 0.84
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SH3BP1-201ENST00000357436 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 FMNL3Q8IVF7 1028 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 RIT2Q99578 217 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.3■□□□□ 0.84
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SH3BP1-201ENST00000357436 MYBPC2Q14324 1141 aa20.3■□□□□ 0.84
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SH3BP1-201ENST00000357436 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 LMO3Q8TAP4 145 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 SYT17Q9BSW7 474 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 PLAAQ9Y263 795 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC172P0C7W6 258 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 VGLL3A8MV65 326 aa20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP1-201ENST00000357436 HSD17B3P37058 310 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 PDCLQ13371 301 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF22Q14807 665 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 SEC14L1Q92503 715 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP1-201ENST00000357436 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 H0YGN5 161 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 IRF6O14896 467 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 PADI6Q6TGC4 694 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.845e-6■■□□□ 11.5
SH3BP1-201ENST00000357436 NEK9Q8TD19 979 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.28■□□□□ 0.84
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