RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320054.4

PRPF18-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF18, Length 788 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18-201ENST00000320054 ACKR2O00590 384 aa14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 TGFB1I1O43294 461 aa14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 PRKCBP05771 671 aa14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 STX17P56962 302 aa14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 MGAT3Q09327 533 aa14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 TMEM62Q0P6H9 643 aa14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 NCAPHQ15003 741 aa14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ZPBP2Q6X784 338 aa14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SCLT1Q96NL6 688 aa14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 RBSNQ9H1K0 784 aa14.93□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 BECN2A8MW95 431 aa14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 THPOP40225 353 aa14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 MYBPC2Q14324 1141 aa14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 CAGE1Q8TC20 777 aa14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SQORQ9Y6N5 450 aa14.92□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.91□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 CHRNA1P02708 482 aa14.91□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 BFSP2Q13515 415 aa14.91□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 AMHR2Q16671 573 aa14.91□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 LUZP1Q86V48 1076 aa14.91□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.91□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 OSMRQ99650 979 aa14.91□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.91□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.91□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 STYXL1Q9Y6J8 313 aa14.91□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.91□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 CITO14578 2027 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 FSD2A1L4K1 749 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 PITPNM1O00562 1244 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 NR3C1P04150 777 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 EDN1P05305 212 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 IQCF3P0C7M6 154 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 CKBP12277 381 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 GARTP22102 1010 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 LIG4P49917 911 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 TPM4P67936 248 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 TLE2Q04725 743 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 TRIM60Q495X7 471 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SLFN12LQ6IEE8 588 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SLC39A4Q6P5W5 647 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 USP38Q8NB14 1042 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 BICD1Q96G01 975 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 CEP63Q96MT8 703 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 THAP9Q9H5L6 903 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 DMAC2Q9NW81 257 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 GINS2Q9Y248 185 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ANK1P16157 1881 aa14.9□□□□□ -0.02
PRPF18-201ENST00000320054 BRCA2P51587 3418 aa14.89□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 SCN5AQ14524 2016 aa14.89□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 TSPAN1O60635 241 aa14.89□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 TOM1L1O75674 476 aa14.89□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 ERLIN2O94905 339 aa14.89□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 PROZP22891 400 aa14.89□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 AXLP30530 894 aa14.89□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 GSE1Q14687 1217 aa14.89□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 UVSSAQ2YD98 709 aa14.89□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms