RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318066.6

UBE2N-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 N, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2N, Length 5,186 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2N-201ENST00000318066 PSD3Q9NYI0 1048 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 AGBL2Q5U5Z8 902 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 PARVAQ9NVD7 372 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 POTEMA6NI47 508 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 HUS1O60921 280 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 CDH16O75309 829 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 IL10P22301 178 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 MDH1P40925 334 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 CDO1Q16878 200 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 RGS9BPQ6ZS82 235 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 SPATA21Q7Z572 469 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 REREQ9P2R6 1566 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 A0A1B0GTH6 734 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 GPS1Q13098 491 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 TBCCQ15814 346 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 HEMGNQ9BXL5 484 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 GPC3P51654 580 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 TXNRD1Q16881 649 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 KCNA4P22459 653 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 HIPK4Q8NE63 616 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 METP08581 1390 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 RAD23BP54727 409 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 GYS2P54840 703 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 NEDD4P46934 1319 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 RTN2O75298 545 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 KRT16P08779 473 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 SERPINB10P48595 397 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 SNX19Q92543 992 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 DYDC2Q96IM9 177 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 WDR35Q9P2L0 1181 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 E9PMD0 336 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 ITIH2P19823 946 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 GNA15P30679 374 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 AP1B1Q10567 949 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 ULK4Q96C45 1275 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 ELF1P32519 619 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 PSMC5P62195 406 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 STILQ15468 1287 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 NLRP4Q96MN2 994 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 SPAG6O75602 509 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 NEK2P51955 445 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 OSTNP61366 133 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 HIC1Q14526 733 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 IFT43Q96FT9 208 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 PSMD3O43242 534 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 COPB2P35606 906 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 SLC18A3Q16572 532 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 EFHC2Q5JST6 749 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 DIAPH2O60879 1101 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 ANP32DO95626 131 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 APOA1P02647 267 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 CDC27P30260 824 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 SERPINB9P50453 376 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 RMDN3Q96TC7 470 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBE2N-201ENST00000318066 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms