RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 VWA3BQ502W6 1294 aa17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 TAS1R3Q7RTX0 852 aa17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 GPIHBP1Q8IV16 184 aa17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 ACCSQ96QU6 501 aa17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 CRACR2AQ9BSW2 395 aa17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 APBA1Q02410 837 aa17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 HS2ST1Q7LGA3 356 aa17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 OTUD6BQ8N6M0 293 aa17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 MAPTP10636 758 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 CASP14P31944 242 aa17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 EFCAB12Q6NXP0 572 aa17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 FAM167AQ96KS9 214 aa17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 CEP63Q96MT8 703 aa17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 IMPACTQ9P2X3 320 aa17.79■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 KLRC1P26715 233 aa17.78■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP17.78■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 DGKDQ16760 1214 aa17.78■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 TCERG1LQ5VWI1 586 aa17.78■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.78■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 RHPN2Q8IUC4 686 aa17.78■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 MMRN2Q9H8L6 949 aa17.78■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 TTLL13PA6NNM8 815 aa17.78■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 HBP1O60381 514 aa17.78■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 CAPSQ13938 189 aa17.78■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 MYADML2A6NDP7 307 aa17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 GYPCP04921 128 aa17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 EDN1P05305 212 aa17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 ADSSP30520 456 aa17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 ELF2Q15723 593 aa17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 MAN2A1Q16706 1144 aa17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 SAAL1Q96ER3 474 aa17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 SETD4Q9NVD3 440 aa17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 EXOC3O60645 756 aa17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 IGHA2P01877 340 aa17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 RFC5P40937 340 aa17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 MAGEA9P43362 315 aa17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 SLC39A4Q6P5W5 647 aa17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM59Q8IWR1 403 aa17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
CHTF18-202ENST00000317063 PGK1P00558 417 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 SKILP12757 684 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 RPL13P26373 211 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 DNM2P50570 870 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 TC2NQ8N9U0 490 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 DEPTORQ8TB45 409 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 SPIRE2Q8WWL2 714 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 BICD1Q96G01 975 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 NLRP4Q96MN2 994 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 FAM184BQ9ULE4 1060 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 MYL3P08590 195 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 PPFIBP1Q86W92 1011 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 RNF149Q8NC42 400 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM206Q9H813 350 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 KLHL33A6NCF5 533 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 A6NJR5 290 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 EPHB6O15197 1021 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 SLC26A2P50443 739 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 CCZ1BP86790 482 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 KCNH2Q12809 1159 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 FAM186BQ8IYM0 893 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 C17orf75Q9HAS0 396 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 DMAC2Q9NW81 257 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 FHOD1Q9Y613 1164 aa17.76■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 K7ERI5 159 aa17.75■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 C22orf31O95567 290 aa17.75■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM49P0CI25 452 aa17.75■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM49CP0CI26 452 aa17.75■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 PLA2G4AP47712 749 aa17.75■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 KIF22Q14807 665 aa17.75■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 KIAA0753Q2KHM9 967 aa17.75■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 C11orf91Q3C1V1 193 aa17.75■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 KAT2BQ92831 832 aa17.75■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa17.75■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 VTNP04004 478 aa17.75■□□□□ 0.43
CHTF18-202ENST00000317063 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms