RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 GINS2Q9Y248 185 aa24.27■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 ARVCFO00192 962 aa24.26■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 CETN3O15182 167 aa24.26■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 PRKCBP05771 671 aa24.26■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 MBTD1Q05BQ5 628 aa24.26■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 NFIL3Q16649 462 aa24.26■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 LRRC55Q6ZSA7 311 aa24.26■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 RSPH3Q86UC2 560 aa24.26■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 IRF2BP1Q8IU81 584 aa24.26■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 CREBRFQ8IUR6 639 aa24.26■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.26■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 CEP63Q96MT8 703 aa24.26■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 FZD8Q9H461 694 aa24.26■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 MINDY3Q9H8M7 445 aa24.26■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 TISP43B9A030 160 aa24.25■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD63C9JTQ0 380 aa24.25■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 LIG4P49917 911 aa24.25■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.25■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 FAM114A1Q8IWE2 563 aa24.25■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa24.25■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 USP20Q9Y2K6 914 aa24.25■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 PIGRP01833 764 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 GJA8P48165 433 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 SPAG1Q07617 926 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 KCNJ18B7U540 433 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 ACKR2O00590 384 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 AP5Z1O43299 807 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 EDN1P05305 212 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 PTK7Q13308 1070 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 KCNJ12Q14500 433 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 TCP11X2Q5H9J9 407 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 ARMCX5Q6P1M9 558 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 SLC39A4Q6P5W5 647 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 RPAINQ86UA6 219 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 SLC9A9Q8IVB4 645 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 WNT8BQ93098 351 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 OSMRQ99650 979 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 DMAC2Q9NW81 257 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 IQCF3P0C7M6 154 aa24.23■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 CYP2J2P51589 502 aa24.23■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 FANCCQ00597 558 aa24.23■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 MYBPC2Q14324 1141 aa24.23■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 ZPBP2Q6X784 338 aa24.23■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 TMEM174Q8WUU8 243 aa24.23■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 CBWD1Q9BRT8 395 aa24.23■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.23■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.23■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 M0QZ92 97 aa24.22■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 GNA14O95837 355 aa24.22■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 SERPINC1P01008 464 aa24.22■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 ADSSP30520 456 aa24.22■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 CDK7P50613 346 aa24.22■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 FAM187BQ17R55 369 aa24.22■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 CEP135Q66GS9 1140 aa24.22■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 SARM1Q6SZW1 724 aa24.22■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa24.22■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 POMGNT1Q8WZA1 660 aa24.22■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.22■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 TTLL13PA6NNM8 815 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 B4GALT4O60513 344 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 TRIM5Q9C035 493 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 HSPBP1Q9NZL4 362 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 EXOC3O60645 756 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 GARTP22102 1010 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 THPOP40225 353 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 CASP4P49662 377 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 SLFN12LQ6IEE8 588 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 TRPV2Q9Y5S1 764 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 CDY2AQ9Y6F7 541 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 STYXL1Q9Y6J8 313 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-201ENST00000312060 B4GALT5O43286 388 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 AKAP3O75969 853 aa24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms