RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299855.9

MMP3-201, Transcript of matrix metallopeptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP3, Length 2,016 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3-201ENST00000299855 ADAMTS4O75173 837 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 PYGLP06737 847 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 TNFRSF8P28908 595 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 HOXC12P31275 282 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 SMTNP53814 917 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 TIMM10P62072 90 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 GNGT1P63211 74 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 FOXO4P98177 505 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 CYP4A11Q02928 519 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 DEUP1Q05D60 604 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 FAPQ12884 760 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 NR1H3Q13133 447 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 NNTQ13423 1086 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 LAPTM5Q13571 262 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 PPP1R7Q15435 360 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 ANKDD1AQ495B1 522 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 BOLA3Q53S33 107 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 EMBQ6PCB8 327 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 ZNF790Q6PG37 636 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 LMBR1LQ6UX01 489 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 TMEM110Q86TL2 294 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 MAGEC3Q8TD91 643 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 NINJ1Q92982 152 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 LRRC45Q96CN5 670 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 EPSTI1Q96J88 318 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 RADILQ96JH8 1075 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 AIFM3Q96NN9 605 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 SLF1Q9BQI6 1058 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 HPF1Q9NWY4 346 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 RWDD2AQ9UIY3 292 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 GUCA1BQ9UMX6 200 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 TACC3Q9Y6A5 838 aa9.84□□□□□ -0.83
MMP3-201ENST00000299855 F8W031 263 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 EYA2O00167 538 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 ZBTB14O43829 449 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 FAM13AO94988 1023 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 ADH7P40394 386 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 TM4SF4P48230 202 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 COPB1P53618 953 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 EPHB4P54760 987 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 RASGRF1Q13972 1273 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 PDIA5Q14554 519 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 ASIC2Q16515 512 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 ZNF827Q17R98 1081 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 WLSQ5T9L3 541 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 FBXW10Q5XX13 1052 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 NECAB2Q7Z6G3 386 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 CCDC50Q8IVM0 306 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 CCDC170Q8IYT3 715 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 ZNF540Q8NDQ6 660 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 OR52K2Q8NGK3 314 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 RIN3Q8TB24 985 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 HPS3Q969F9 1004 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 RMDN3Q96TC7 470 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 PRKAG3Q9UGI9 489 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 UBN2Q6ZU65 1347 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 NHSQ6T4R5 1651 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 NMT2O60551 498 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 TGDSO95455 350 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 DNTTP04053 509 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 ASMTP46597 345 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 RWDD2BP57060 319 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 HAND2P61296 217 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 KRT31Q15323 416 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 INAQ16352 499 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 SLC9B2Q86UD5 537 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 EPHX4Q8IUS5 362 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 TPH2Q8IWU9 490 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 SPERTQ8NA61 448 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 C3orf20Q8ND61 904 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 CAVIN3Q969G5 261 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 PAGE5Q96GU1 130 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 CAPN11Q9UMQ6 739 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 GPR52Q9Y2T5 361 aa9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
MMP3-201ENST00000299855 CAPN7Q9Y6W3 813 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms