RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF410Q86VK4 478 aa8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOC8Q8IYI6 725 aa8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 HACE1Q8IYU2 909 aa8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 CNNM3Q8NE01 707 aa8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS6KC1Q96S38 1066 aa8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 IER2Q9BTL4 223 aa8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 GABBR1Q9UBS5 961 aa8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.87□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM170BA6NMN3 283 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 ANHXE9PGG2 379 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC30A4O14863 429 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 OFD1O75665 1012 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNE2O96020 404 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP21A2P08686 494 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 FSHRP23945 695 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 SFNP31947 248 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC11A1P49279 550 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR65Q8IYL9 337 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 MYADMQ96S97 322 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXQ1Q9C009 403 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 RSAD1Q9HA92 442 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 TPRP12270 2363 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 SMCO2A6NFE2 343 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 NRP1O14786 923 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 XYLBO75191 536 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 RETP07949 1114 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 LIFRP42702 1097 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS9P46781 194 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 OR1G1P47890 313 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 JAK3P52333 1124 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 HTR4Q13639 388 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 LIN9Q5TKA1 542 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 CHD1LQ86WJ1 897 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 FANCBQ8NB91 859 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 MYL10Q9BUA6 226 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 NT5C3AQ9H0P0 336 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 CDH7Q9ULB5 785 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 MAN2B1O00754 1011 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX28O15482 410 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 PRC1O43663 620 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 LILRB3O75022 631 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 LILRB5O75023 590 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP3A4P08684 503 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP4AP20648 1035 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 CNR2P34972 360 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 GPC5P78333 572 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKCEQ02156 737 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 USP41Q3LFD5 358 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 TMTC3Q6ZXV5 915 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 LPPQ93052 612 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 SENP2Q9HC62 589 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 LTB4R2Q9NPC1 389 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 DISC1Q9NRI5 854 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJB4Q9UDY4 337 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-201ENST00000296642 EPG5Q9HCE0 2579 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 DMDP11532 3685 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 C2orf16Q68DN1 1984 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PGGT1B-201ENST00000296642 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms