RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.14■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 EBF2Q9HAK2 575 aa20.14■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 VAV3Q9UKW4 847 aa20.14■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 FAM13AO94988 1023 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 RARAP10276 462 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 PAX7P23759 505 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 CTNNA2P26232 953 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 CRYMQ14894 314 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 NAA25Q14CX7 972 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 Q4G0T1 1027 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 CFAP73A6NFT4 308 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 ZBTB39O15060 712 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 TBX3O15119 743 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 EYA4O95677 639 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 NCALDP61601 193 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 AP3B2Q13367 1082 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 RIPK1Q13546 671 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 LONRF1Q17RB8 773 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 AGAP11Q8TF27 550 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 TMEM109Q9BVC6 243 aa20.13■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 A0A1B0GUA9 196 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 PODXLO00592 558 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 FTLP02792 175 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 CREB1P16220 341 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 KCNJ1P48048 391 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 PDE6CP51160 858 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 GTF2IP78347 998 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 CLUL1Q15846 466 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 USH1GQ495M9 461 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 DYDC1Q8WWB3 177 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 AGPAT1Q99943 283 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 MLXIPLQ9NP71 852 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 RARGP13631 454 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 MYL7Q01449 175 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 KIF22Q14807 665 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 TAOK1Q7L7X3 1001 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 CNBD1Q8NA66 436 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 RDH13Q8NBN7 331 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 BANK1Q8NDB2 785 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 PARP2Q9UGN5 583 aa20.12■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 ANP32DO95626 131 aa20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 PYGMP11217 842 aa20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 NQO1P15559 274 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 COMTP21964 271 aa20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 MESDQ14696 234 aa20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 SLMAPQ14BN4 828 aa20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 ECT2Q9H8V3 914 aa20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 POLLQ9UGP5 575 aa20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 PFASO15067 1338 aa20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 GAP43P17677 238 aa20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 ATP2B4P23634 1241 aa20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 LLGL1Q15334 1064 aa20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 CROCCP2Q86T23 111 aa20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 HOOK2Q96ED9 719 aa20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 ALAS1P13196 640 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 HSPA6P17066 643 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 PEX5P50542 639 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 KIF2BQ8N4N8 673 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 ART4Q93070 314 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 FAM20AQ96MK3 541 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 C15orf41Q9Y2V0 281 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 TMEM120BA0PK00 339 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 A8MUI8 341 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 ACSL3O95573 720 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms